非标（Label free）蛋白质组学技术

蛋白质非标记定量技术（label-free）是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。

技术原理

现有基于质谱的非标记定量技术主要有两种：一种是依据一级质谱相关的肽段峰强度(peak intensity)和峰面积(peak area)等信息进行蛋白定量，另一种是依据蛋白质对应肽段的二级质谱总数(spectral counts)进行定量。

技术优势

• 无需昂贵的同位素标签做内部标准，实验耗费低；

• 对样本的操作少，从而使其最接近原始状态；

• 不受样品条件的限制，克服标记定量技术在对多个样本进行分析方面的缺陷；

• 对实验操作稳定性、重复性要求高，要求至少做三次生物重复。

应用领域

• 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；

• 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；

• 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；

• 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等；

• 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；

• 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；

• 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等；

• 食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等。

样品要求

• 组织类型：动物组织≥100mg、植物组织≥100mg、微生物≥20mg；

• 细胞样品：每样品细胞量 ≥ 1X10⁷

• 蛋白提取物：≥100µg

• 体液：血清/血浆≥200µL、尿液≥1ml、唾液/脑脊液≥1ml、泪液≥1mL、支气管灌洗液≥3ml；

• 外泌体：≥10µL

• FFPE石蜡包埋切片：≥0.3 mm * 0.3 mm

参考文献

[1]. Niemann M, Wiese S, et al. Mitochondrial outer membrane proteome of Trypanosoma brucei reveals novel factors required to maintain mitochondrial morphology. Mol Cell Proteomics. 2013; 12(2): 515-28.

[2]. Vanderschuren H, Nyaboga E, et al. Large-Scale Proteomics of the Cassava Storage Root and Identification of a Target Gene to Reduce Postharvest Deterioration. Plant Cell. 2014.

[3]. Cholewa BD, Pellitteri-Hahn MC, et al. Large-Scale Label-Free Comparative Proteomics Analysis of Polo-Like Kinase 1 Inhibition via the Small-Molecule Inhibitor BI 6727 (Volasertib) in BRAFV600E Mutant Melanoma Cells. J Proteome Res. 2014 Jun 9.

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