lncRNA测序

一、服务介绍

长链非编码RNAs（long non-coding RNAs，lncRNAs）一般是指长度大于200 nt的RNA，位于细胞核内或胞浆中，不参与蛋白质编码功能，以RNA形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平，在生命活动中具有重要作用。

长链非编码RNA测序（long non-coding RNA sequencing，lncRNA-Seq）是一种使用特定方法降低样本中rRNA 的丰度，对富集到的 RNA进行文库构建，再对高通量测序仪产出的数据进行信息分析的研究方法。lncRNA-Seq可一次性获得样本中大部分的lncRNAs信息，对lncRNAs的类别、功能进行深入分析，从而快速准确地获得与特定生物学过程（例如发育、**等）相关 lncRNA信息。

二、数据分析内容

标准分析项目

1) 去除接头序列、低质量序列，得到高质量数据；

2) 与核糖体数据库比对，去除核糖体RNA（rRNA）数据

3) 转录本组装；

4) 鉴定已知转录本（包括已知lncRNA）和新转录本；

5) 预测新的lncRNA；

6) lncRNA定量及差异分析（需至少2个样品）；

7) lncRNA差异表达模式聚类；

分析项目

基于互补序列的lncRNA-mRNA互作分析；

构建重要的lncRNA-mRNA网络图；

网络拓补学分析及网络模块分析；

功能富集分析；

ceRNA预测分析；

三、样品要求

1.样品类型：细胞、新鲜组织或RNA样品。

2.样品量：细胞样品请提供至少1×107个细胞，组织样品请提供至少300mg的组织块或切片，RNA样品请提供10 μg以上的总RNA。

3.样品质量：RNA无明显降解，提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间，浓度≥ 500 ng/μl，28S:18S ≥ 1.5，RIN ≥7。

4.样品保存：细胞样品或新鲜组织块（切成~50mg的小块）可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后，-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中，-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。

5.样品运输：样品置于1.5 ml管中，封口膜封好，干冰运输。

lncRNA测序信息由基尔顿生物科技（上海）有限公司为您提供，如您想了解更多关于lncRNA测序报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途