特异位点甲基化检测

特异位点甲基化检测

A.焦磷酸测序

焦磷酸测序可在一次检测中快速定量一个或多个甲基化位点，是较为理想的验证方法，

该技术在表观遗传学研究中逐渐成为数据分析的金标准。
基于QIAGEN公司的PyroMark Q96 ID平台，应用焦磷酸测序（Pyrosequencing）技术，

不仅能解决常规焦磷酸测序法在非CpG位点胞嘧啶转化为胸腺嘧啶时影响到引物的结合的问题，

也进一步提高了结果的准确性；同时，给予的结果除了能准确定性检测到位点变化情况之外，还能准确地计算频率变化。

焦磷酸测序技术优势

先进的算法设计可优化实验条件，内嵌式的质控保证数据的准确可靠
全程的软件控制减少人为因素的影响
灵敏度高，可测到邻近CpG区域的单个甲基化水平
周期短、通量高，1h内可同时平行分析96个样本，一次运行可实现多个续CpG位点定量分析
对于样品要求低，适用于新鲜、冷冻和FFPE样本
对于检测位点要求低，可检测未知序列信息，覆盖到人类基因组的所有CpG位点
除常规的检测位点变化情况外，还可准确计算频率变化

焦磷酸测序服务内容

对客户提供样本进行DNA抽提，并利用NanoDrop进行样本质检
根据不同的实验目的，确定合适的检测方法，完成相应的实验
提供包括实验操作流程、原始数据、分析数据在内的详细实验报告

焦磷酸测序结果展示

B.Sequenom检测

通过高通量甲基化检测手段筛选到目标位点后，需要对目标位点进行验证，

可采用特异位点甲基化检测技术，比较常见和有效的除了焦磷酸测序之外，还有Sequenom检测。

C.特异位点甲基化检测技术比较

常见问题

1. 如何判断选择哪种技术检测特异性位点的甲基化情况？
选择哪种技术是和实验本身直接相关的，目标序列的长度、检测达到的精度、样本的数目等都是选择技术前需要考虑的问题。

2. 想用焦磷酸测序来检测甲基化，但目标序列有几百bp，怎么办？
如果是想检测目标序列中的所有CpG位点的甲基化水平，可以将目标序列拆分成几个反应进行；如果着重关注某几个目标位点，可以只针对目标位点周围设计引物检测，没有必要对整段序列进行测序

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途