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参考报价: | 面议 | 型号: | miRNA-miRNA-correlation Network |
品牌: | 中康博生物科技 | 产地: | 中国 |
关注度: | 16 | 信息完整度: | |
样本: | 典型用户: | 暂无 |
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构建MicroRNA-MicroRNA共调节网络(miRNA-miRNA-correlation)
既往研究已证明不同microRNA通过相互之间合作,共同调控靶基因。利用数据库及算法预测miRNA靶基因,当两个miRNA共调控至少一个靶基因时,认为两个miRNA间存在共调节关系。基于这些的关系构建差异miRNA与miRNA的共调节网络。根据网络中miRNA的位置函数计算出miRNA在网络中的关系强度,即miRNA的网络特征值。特征值最高miRNA处于网络的枢纽性地位,该miRNA拥有最多的共调节伙伴。这种对miRNA间合作行为特性的研究,能够帮助我们更好的理解miRNA的调控机理。结果样式如下:
Demo:
文章案例:研究通过构建miRNA-miRNA共调节网络发现let-7a / b / c / f协同调控,这些结果对于理解肺癌中复杂的转录后调控的机制是有生物学意义的。
参考文献:Renhua Song et al. Identification of lung cancer miRNA–miRNA co-regulation networks through a progressive data refining approach. Journal of Theoretical Biology. 2015.
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