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使用了DS3000 Compact CE Sequencer的短DNA的读取精度的提高

发布时间: 2023-10-19 16:10 来源: 日立诊断产品(上海)有限公司
领域: 分子生物学,基因/基因组/测序,其他生命科学,基因编辑
样品:质粒DNA(pTS1,日本基因) ,T3引物项目:使用 DS3000 Compact CE Sequencer提高了开始读取区域的数据质量

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使用了DS3000 Compact CE Sequencer的短DNA的读取精度的提高

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在Sanger测序中,时有在开始读取的区域中无法获得峰波形,或者出现读取错误的情况。这是由于填充在毛细管中的电泳介质 (聚合物) 有无法正确检测,分离短DNA的情况。此实验是使用 DS3000 Compact CE Sequencer,提高了开始读取区域的数据质量1的示例。为了改善, 使用了加尾引物。尾部是添加到测序引物5’末端的任意碱基序列。由于尾部可延长反应产物, 因此可通过电泳分离。当添加40个碱基至尾部时,可从测序引物的3’末端下游第1个碱基的 DNA开始无错误地读取。另一方面,显示出读取碱基的长度缩短了相当于尾部的长度。在添加尾部时,请参考本报告,事先确认必要的分析区间。

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