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S1分析酵母基因寡核苷酸探针

关键词:  S1 酵母基因 寡核苷酸 探针来源: 互联网

  一、操作步骤

  1. 在0.5 mL Eppendorf管中混合以下:

  10-20 ug 酵母RNA

  10 ul 杂交组合

  加水,使终体积25 ul

  40 ul 矿物油

  在100度加热反应2分钟,转移到55度过夜(12-16小时)杂交(的准确温度将取决于寡核苷酸的长度和组成)。

  2. 培养过夜后,旋管和1.5 ml 离心管中取出水层。添加275 ul S1组合,并培育在37度10-30分钟。取决于探头。

  3. 6 ul 终止缓冲液+ 900 ul ETOH和执行标准的沉淀。洗净用80%ETOH粒料。重悬在6 ul 甲酰胺测序凝胶上样缓冲液含有0.1%SDS。加载样品8%测序凝胶。

  二、功能

  重要的控制功能有:

  一、与没有核酸激酶探针。

  二、含有可变数量的总RNA的反应。信号应该是线性的,如果结果是越来越多的RNA定量。

  三、没有S1的测序凝胶的质量和大小的探头没有S1的治疗观察治疗探头负载500-1000每千次展示费用。

  杂交组合:

  1X S1缓冲区:

  4 uM 硫酸锌

  30 mM 醋酸钠pH 4.6

  250 mM 氯化钠

  10 ml 10X S1缓冲区

  0.4 ml 1 M硫酸锌

  3 ml 1 M醋酸钠

  6.25 ml 4 M氯化钠

  0.35 mL 水

  S1组合:

  27.5 ul 10X S1缓冲区

  2.7 ug 变性鲑鱼精子DNA

  共85个单位S1核酸酶(GIBCO / BRL)

  H2O至最终体积为275 ul/反应

  停止液:

  6 ul 0.25 M EDTA

  2 ug 的tRNA(大于10 mg/ml)

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