亦称内混合。指在部分纤毛虫类中所见到的自体配合的一种类型，即在两个个体间所需进行的接合却发生在一个个体中，从而使大核得到改造的现象。例如，在大草履虫（ Paramoecium caudatum）中，一个个体的大核破裂之后而消失，其小核通过二次分裂成为四个核，其中三个核消失之后剩下一个核（可理解为减数分裂结束的产物），而这一个核具有与接合体中的接合核相同的行为。即进行三次分裂，成为八个核，其中四个成为大核，四个成为小核，再通过二次草履虫体分裂，生成四个个体。虽然内融合不会发生由小核（生殖核）进行的融合所产生的基因交换和混合，但是实际上可认为对于表型是具有意义的，这是因为它与大核的改造有关。