然而，行业抱怨新标准使成本增加。电力行业一直声称煤价过高导致严重亏损，今年春季电荒期间发电小时数更是跌到历史新低。更严格的脱硝要求既增加一次性设备改造成本，又长期增加运行成本，电力行业自然要与国家讨价还价。坊间传说，经过博弈之后正式通过的版本中，氮氧化物的排放限制已经没有《二稿》设计的那么严格。

　　我国在“十一五”已经建立了一套可执行的脱硫补贴，以0.015元/kWh脱硫电价加价来激励电厂实施脱硫，并初步建立了一套监管、惩罚机制。虽然补贴不能完全负担脱硫的全部运行成本，但极大促进了“十一五”期间脱硫工作的开展。显然，环保部正在研究的与脱硝标准变化相关联的脱硝电价补贴成为当前业界内外最大的看点。

　　另外，根据《二稿》要求，所有现役机组均需在2014年前完成改造，达到新的标准。但电力行业希望能延缓提高现有火电机组排放标准的进程，放松对现有机组的要求。与此同时，各大电力公司都大规模地加快了在中国西部各省上马新火电项目的速度，由于新的标准尚未出台，所有审批通过的项目污染物排放标准以及治理设施均执行较松的旧标准，对现有火电厂的脱硫脱硝改造要求会不会推迟成为人们关注的另一个焦点。显然，这与我国西部的环境、乃至全国的污染物总量减排密切相关。