Nature发表蛋白质互作里程碑成果
德克萨斯大学和多伦多大学的科学家们日前绘制了超大规模的蛋白质互作图谱。这项研究发表在九月七日的Nature杂志上，为研究阿尔茨海默症、帕金森症和癌症等疾病的提供了强大的新工具。
细胞中的蛋白通常以蛋白复合体的形式，执行特异性的生物学功能。研究人员发现，海葵、线虫、小鼠和人类共享近千种关键的蛋白复合体，这些蛋白复合体对动物的生存和发育非常重要。举例来说，这些动物使用同样的蛋白复合体，来确保头部和眼部正确形成。
“我们可以在绝大多数动物的细胞中，绘制数千种不同蛋白的装配图，”德克萨斯大学的Edward Marcotte教授说。“人类蛋白复合体的装配往往与其它物种没什么两样。这类研究不仅能加深我们对共同进化祖先的认识，也有助于研究多种疾病的遗传学基础。”
研究人员选择了有代表性的九个物种（包括线虫、果蝇、小鼠、人类、海胆、海葵、青蛙、霉菌和酵母），对细胞中的蛋白进行了高通量质谱分析。随后，他们将质谱分析的数据与已知的基因组信息相互对照。
“我们使这些动物中的已知蛋白互作增加到了原来的三倍，这是绘制蛋白互作网络的一大进步，”多伦多大学的Andrew Emili教授说。
细胞内任何一个蛋白互作的缺失都有可能引发疾病，而蛋白互作图谱可以帮助人们鉴定复杂疾病的根源。据介绍，这项研究中的数据将录入开放获取数据库，对全世界的研究者们开放。
值得注意的是，这一图谱已经在疾病研究中初露锋芒，比如新发现的蛋白复合体Commander。Commander由十几个蛋白组成，并且存在于所有动物细胞。研究人员发现，这些蛋白的编码基因与人类智力障碍有关。于是他们在蝌蚪中破坏了Commander的蛋白组分，结果胚胎发育过程中的脑细胞定位发生了异常。这说明智力障碍可能与脑细胞定位异常有关。
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