Agilent miRNA芯片在各类样本中的应用（一）
1.新鲜组织样本
新鲜组织一般包括以人类疾病诊断及治疗为目的，经患者或健康人同意后，从患者的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的病变组织或相邻健康组织，或者健康人的相同部位的对照组织。这些人类疾病相关的新鲜组织样本的整理、保存、研究对于提高疾病的诊断质量、促进临床工作、探讨及研究疾病的发病机制具有重要的意义。此外，新鲜组织样本还包括从其他物种的机体中切取的未经特殊化学试剂处理的样本。采用新鲜组织样本，并使用Agilent miRNA芯片，可以对新鲜样本的miRNA表达谱进行及时直接的监测，从而对疾病，或者动植物的不同发育阶段，不同器官的miRNA表达谱进行研究，了解miRNA的表达趋势变化，和相应的功能。上海伯豪生物技术有限公司为客户提供了多年优质的Agilent miRNA芯片服务，发表了一系列相关论文。
伯豪案例选摘：
肺癌组织样本：
Huang W, Hu J, Yang DW, Fan XT, Jin Y, Hou YY, Wang JP, Yuan YF, Tan YS, Zhu XZ, Bai CX, Wu Y, Zhu HG, Lu SH. Two MicroRNA Panels to Discriminate Three Subtypes of Lung Carcinoma in Bronchial Brushing Specimens. Am J Respir Crit Care Med2012 Dec 1;186(11):1160-7.
大肠癌组织样本：
Wang S, Wang L, Bayaxi N, Li J, Verhaegh W, Janevski A, Varadan V, Ren Y, Merkle D, Meng X, Gao X, Wang H, Ren J, Kuo WP, Dimitrova N, Wu Y, Zhu H. A microRNA panel to discriminate carcinomas from high-grade intraepithelial neoplasms in colonoscopy biopsy tissue. Gut. 2013 Feb;62(2):280-9.
肾细胞癌组织：
Chen X, Wang X, Ruan A, Han W, Zhao Y, Lu X, Xiao P, Shi H, Wang R, Chen L, Chen S, Du Q, Yang H, Zhang X. miR-141 Is a Key Regulator of Renal Cell Carcinoma Proliferation and Metastasis by Controlling EphA2 Expression. Clin Cancer Res. 2014 20: 2617-30.
子宫颈癌组织：
Ke G, Liang L, Yang JM, Huang X, Han D, Huang S, Zhao Y, Zha R, He X, Wu X. MiR-181a confers resistance of cervical cancer to radiation therapy through targeting the pro-apoptotic PRKCD gene. Oncogene 2013 Jun 20;32(25):3019-27.
大鼠神经组织：
Yu B, Zhou S, Wang Y, Qian T, Ding G, Ding F, Gu X.miR-221/222 promote Schwann cell proliferation and migration by targeting LASS2 following sciatic nerve injury. J Cell Sci. 2012 Jun 1;125(Pt 11):2675-83.
小鼠大肠癌模型组织：
Gao Y, Li X, Yang M, Zhao Q, Liu X, Wang G, Lu X, Wu Q, Wu J, Yang Y, Yang Y, Zhang Y. Colitis-Accelerated Colorectal Cancer and Metabolic Dysregulation in a Mouse Model. Carcinogenesis. 2013 Aug;34(8):1861-9.
2.FFPE样本
使用芯片技术研究miRNA通常需要使用新鲜的样本或快速冷冻的样本。但是世界上大约有数十亿份组织样品保存在医院或者组织样品库中，绝大多数是使用福尔马林固定石蜡包埋的方法处理(Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded，FFPE)的样品。数量巨大的样品蕴含着无限的科学研究的机会同时也是研究者们很棘手的研究对象。如何从这些样品中获取我们需要的生物信息呢？ Queen’s Cancer Research Institute的研究者使用Agilent miRNA芯片对快速冷冻的样本以及与之相匹配的相应的FFPE样本进行了研究。 结论证实：检测FFPE样本中的miRNA在技术上是可行的；Agilent miRNA芯片平台的数据显示出其在抽提、标记和杂交过程中的高度重复性。
利用Agilent miRNA芯片可以对FFPE样本进行miRNA的表达谱研究，为挖掘FFPE样本的巨大应用价值提供了新的方法。
伯豪案例选摘：
Fang Y, Yu X, Liu Y, Kriegel AJ, Heng Y, Xu X, Liang M, Ding X. miR-29c is downregulated in renal interstitial fibrosis in humans and rats and restored by HIF-α activation. Am J Physiol Renal Physiol. 2013, 304(10):F1274-82.
