GPARC项目的主要目标之一就是发现疟原虫耐青蒿素的分子耐药机制，但是这个目标实现起来却有一定的难度，因为正如我们前面介绍的那样，现在很难在实验室里明确地、可重复地界定“耐药性”这个特性。所以科研人员们只能依靠遗传流行病学(genetic
epidemiology)，在疟原虫的基因组当中寻找可能与耐药性有关的蛛丝马迹。在这些研究工作中，科学家们同时对采集自有耐药疟原虫肆虐，和没有耐药疟原虫肆虐地区疟疾患者的疟原虫DNA标本进行了分析。利用疟原虫会在蚊子体内进行有性繁殖(sexual
crosses)的特点，以及传统的基因分型技术(genotyping
techniques)，和最近新发展起来的全基因组测序技术，科学家们终于在疟原虫的基因组中发现了与对青蒿素耐药特性相关的遗传位点，如图1所示。然后，科学家们对存在于这些位点里的基因进行了功能研究，以确定它们是不是与耐药性有关。