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测序结果能知道各个细菌种类的含量分别是多少吗

2021.12.23

测序分为一代测序和二代测序(两者差别,一代测序准确性高,通量低,二代测序通量高)
一般确定各个细菌种类的含量,专业上讲叫种群丰度
一般观察这种丰度细菌是通过16S rDNA的高变区V区来确定物种
一代测序是通过PCR来扩增出特定V区,进行克隆后,一代测序进而分析,但是克隆挑选的数目对丰度的准确评估有很大影响(越多越好)
二代测序pcr后直接进行测序,来找特定丰度,二代测序的高通量有这更好的适用性。

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