影响DNA分子在琼脂糖凝胶电泳仪中泳动度的因素
影响DNA分子在琼脂糖凝胶电泳仪中泳动度的因素有DNA分子性质、琼脂糖凝胶浓度、电场强度和缓冲液离子强度等。
一、DNA分子性质：
DNA分子性质包括DNA分子电荷数、大小和空间构型等。
1、DNA分子电荷数：
一般来说，分子的电荷密度越大，泳动度越大。但不同核酸分子的电荷密度大致相同，因此对泳动度影响不大。在中性或碱性时，单链DNA与等长的双链DNA的泳动度大致相同。
2、、DNA分子大小：
对于线形分子，分子量的常用对数与泳动度成反比。
用标准样品进行电泳并测定其泳动度，然后用DNA分子长度（bp）的负对数对泳动距离作标准曲线，可测定未知分子的长度。
3、DNA分子空间构型：
DNA分子空间构型对泳动度影响很大。如质粒分子的泳动度大小顺序为共价闭环DNA＞直线DNA＞开环双链DNA。
二、琼脂糖凝胶浓度：
不同浓度的琼脂糖凝胶构成的分子筛的网孔大小不同。选择不同浓度的凝胶，可分离不同大小的DNA分子。
琼脂糖凝胶适合分离长度为200bp～50kb的DNA分子。
三、电场强度：
电场强度高，电泳迁移加快。但琼脂糖凝胶的有效分离范围随着电压的增大而减小。
四、缓冲液离子强度：
核酸电泳常采用TAE、TBE和TPE三种缓冲系统，各有利弊。
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