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被几只猴子救活的蛋白芯片数据

2021.6.19

随着层出不穷的生物学研究和分析方法的发展,我们手里可能都会积攒下很多数据,但往往这些数据并不会按照我们的预想去排布和集中,一整套分析下来往往得不到预先假设的结果,或者根本就是理论和数据南辕北辙,如何去处理科研假设与数据之间的冲突,我们也一直在探索着如何让科研思路追着数据走,数据又怎样不断校正科研设想的科研方式。我将跟大家一起分享的就是一个猜得到开头,猜不到结尾的真实故事。
 

它开始于2013年,我们用了整整1年时间收集了近300例患者的纯化CD4+T细胞标本,进行了一个大型的磷酸化蛋白芯片检测,这其中的酸爽,自然也是不言而喻。但是拿到这个大队列的研究结果以后却发现,与我们之前的小规模实验结果不同, 这次我们并没有看到预想的与病毒控制相关的阳性结果,只有0.043的p值让课题组的每一个人都很沮丧,数据沉在手里不知该如何朝下走,甚至课题组主要成员也相继离开各奔前程,磷酸化蛋白芯片结果也变成了实验室的压箱底数据。
 

故事的转机发生在2018年,一篇Science文章的几只猴子搬来了救兵,猴子的数据提示我们磷酸化蛋白的改变对免疫细胞迁移的影响远大于对病毒的控制,我们及时的调整了分析策略,将芯片数据重新与免疫相关指标进行分析,更幸运的是队列中的感染者在此后的5年中依然坚持了半年一次的随访,因此我们还拿到了他们治疗后的免疫恢复相关数据,综合分析中果真看到了明显的差异及相关性,而这些差异都集中在免疫损伤及重建相关的指标上。
 

在这一轮芯片数据分析后,我们又通过几轮课题组共同讨论,提出了促进免疫循环,帮助免疫功能重建的全新理论,按照这个理论我们构建了体外细胞模型,研究结果一个一个迸发,理论在体外功能研究中得到了验证。至此完成了从数据总结理论,并根据理论得出数据的过程。为感谢Science文章的猴子们,我们也将文章投稿Science杂志子刊Science Advances并于2019年发表。
 

作为一名工作于检验科的科研人员,这就是我要跟大家分享的科研小故事,希望为手握数据,欲想退出的你带来坚持的动力和希望。


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