高通量筛选：化合物库在药物研发过程中的应用-MedChe...-2
二、化合物库使用方法及使用注意事项
化合物库筛选过程主要包括化合物库选择、实验方案设计、实验进行、实验结果检测、实验方案优化等步骤。
进行化合物库筛选，要根据自己的实验目的选择合适的化合物库，设计适合的实验方案，并设计好化合物作用结果的检测指标及检测方法。化合物库筛选的实验方案设计至少需要包括以下几个要素：①重复孔设置；②浓度/时间梯度设置；③对照组设置等。其中对照组设置又包括阳性对照（已有文献报道可以达到实验目的的化合物）、溶剂设置（根据化合物库中化合物的溶剂情况，设置不同的对照，理论上每种溶剂均需要设置对照）、空白对照等。按照设计好的实验方案进行实验，第一轮筛选得到初步的阳性结果之后，还可以根据具体的研究目标对实验方案或筛选到的化合物进行优化。
图4. 化合物筛选实验设计示意图
三、MCE化合物库优势
基于化合物库筛选的研究成果高效持续
基于化合物库筛选的研究课题，通常可以借助高通量的筛选平台，可大大提高课题进展的速度。而且，由于采用了化合物库筛选的研究课题通常是更加具有系统性的工作，因此得到的研究成果的质量也相对较高。据统计，近三年来采用MCE化合物库发表的文章平均影响因子约为7.64。此外，基于筛选化合物库筛选进行的研究课题更加具有持续性，可支持多篇学术论文的发表。
化合物库种类齐全，化合物库中产品种类多样
作为全球领先的科研化学品和生物活性化合物供应商，MCE可提供60多种活性化合物库，总计10000+具有生物活性的小分子化合物，可用于高通量筛选 (HTS)和高内涵筛选 (HCS)，是进行新药筛选和新适应症发现等研究的专业工具。
MCE提供的化合物库基本涵盖了热门的研究领域（肿瘤、干细胞、神经、表观遗传等）、信号通路（TGFβ、mTOR、NF-κB等）及蛋白靶点（激酶、GCPRs，离子通道等）并包含多种上市及处于临床期药物、天然产物及具有特定结构的化合物。此外，为了满足所有科研工作者的个性化需求，MCE还可以提供化合物库定制服务，定制范围包括化合物种类、化合物规格、化合物库包装形式等。
先进的化合物库管理系统
为了解决大量活性分子的综合管理问题，MCE建立了高效的管理平台。该平台紧跟国际新药创制的前沿方向，按照我国生物医药产业的发展战略，采用新型的管理模式，通过建立大规模化合物样品库发展、管理、维护和使用规范，服务于我国创新药物的研究和开发。
该平台保证MCE在研发过程的化合物库中活性分子数目的持续更新，生产和存储过程化合物的质量控制，对数目庞大的活性分子进行有效分类以及对活性分子相关信息（药效药理数据等）的集成与管理。
400万+化合物
小分子药物虚拟筛选中，化合物库“越大越好”；但也需考虑化合物合成问题，这样才能避免“筛到买不到”的窘境。MCE与Enamine、LifeChemicals、Chemspace强强联合，可提供400万+有库存、结构多样、具有类药性的化合物及38种化合物库。化合物库包括蛋白-蛋白相互作用库、靶向RNA的小分子库、结构新颖且多样性丰富的多样性库、共价化合物库、靶点库 (GPCR、激酶、离子通道等)等等。
| Cat. No. | Product name | Format/Size | Descriptions |
| HY-L0051V | HTS Compound Library | 2,121,382.00 | Enamine HTS Collection contains 2,121,382 diverse screening compounds. These compounds frequently have unusual structures and unique properties. The collection is particularly recommended for the researchers looking for most diverse screening set. |
| HY-L0052V | Advanced Library | 482,182.00 | Enamine Advanced Collection contains 482,182 compounds that have lead-like properties with MW ≤ 350, ClogP ≤ 3, and RotBonds ≤ 7 and/or valuable pharmacophores such carboxylic, primary amino and amide groups. |
| HY-L0053V | Premium Library | 43,525.00 | Enamine Premium Collection contains over 43,525 compounds having most favorable molecular properties (high Fsp3, low logP and MW). |
| HY-L0072V | Agro-like Library | 10,240.00 | Library of compounds intended for use in agro/crop science. |
| HY-L0073V | Antiviral Library | 3,933.00 | Designed for discovery of new Nucleoside-like antivirals |
| HY-L0091V | Chemspace Lead-Like Compound Library | 981,244.00 | Chemspace Lead-Like Compound Library contains 981,244 in-Stock lead-like compounds with favorable physicochemical profiles and high Quantitative Estimation of Drug-likeness. |
| HY-L0065V | CNS Library | 38,080.00 | Library of novel small molecules with high CNS MPO scores. |
| HY-L0076V | Covalent Screening Library | 14,249.00 | A set of screening compounds bearing “warheads” for covalent target modification. |
| HY-L0054V | Discovery Diversity Set 10 | 10,560.00 | Enamine Discovery Diversity Sets (DDS) are high-quality compound libraries focused on novel chemotypes and non-trivial structures. They compose of DDS-10 (10,560 compounds) and DDS-50 (50,240 compounds) sets which do not overlap. Discovery Diversity Set 10 contains 10,560 diverse screening compounds. |
| HY-L0055V | Discovery Diversity Set 50 | 50,240.00 | Enamine Discovery Diversity Sets (DDS) are high-quality compound libraries focused on novel chemotypes and non-trivial structures. They compose of DDS-10 (10,560 compounds) and DDS-50 (50,240 compounds) sets which do not overlap. Discovery Diversity Set 50 contains 50,240 diverse screening compounds. |
| HY-L0077V | DNA Library | 5,530.00 | Designed for identification of new actives against proteins essential for DNA stability. |
| HY-L0078V | Epigenetics Library | 9,353.00 | Library of compounds focusing to hit on a number of epigenetic targets. |
| HY-L0058V | GPCR Library | 54,080.00 | Designed for discovery of new GPCR ligands. |
| HY-L0056V | Hit Locator Library 300 | 300,115.00 | Enamine Hit Locator Library (HLL) is a sizable highly diverse screening set of 300,115 novel screening compounds. |
| HY-L0067V | Immuno-Oncology Library | 52,935.00 | Designed for discovery of novel hits in Immuno-Oncology therapeutic area. |
| HY-L0064V | Ion Channel Library | 36,800.00 | Designed for discovery of new Ion Channels ligands. |
| HY-L0061V | Kinase Library | 64,000.00 | Designed for discovery of novel protein kinase inhibitors. |
| HY-L0088V | Life Chemicals 50K Diversity Library | 50,240.00 | Life Chemicals 50K Diversity Library contains 50,240 diverse screening compounds. |
| HY-L0087V | Life Chemicals HTS Compound Collection | 465,800.00 | Life Chemicals HTS library is a unique collection contains 465,800 diverse screening compounds for the lead identification via high-throughput screening (HTS) and high content screening (HCS). |
| HY-L0082V | Nucleoside Mimetics Library | 290.00 | A set of Nucleoside Mimetics. |
| HY-L0066V | Protein-Protein Interaction Library | 40,640.00 | Designed for discovery of novel PPI inhibitors. |
| HY-L0084V | RNA Library | 8,960.00 | Library of compounds capable of binding to RNA. |
| HY-L0086V | Specs HTS Compounds Library | 210,070.00 | Specs HTS library is a unique collection contains 210,070 diverse screening compounds for the lead identification via high-throughput screening (HTS) and high content screening (HCS). |
注：
1、每个库中的分子数量实时变动，以上分子数量仅供参考，以官网实时数据为准。
2、更多数据库详见MCE官网。
产品推荐：
生物活性化合物库
（https://www.medchemexpress.cn/screening/Bioactive_Compound_Library.html）
生物活性化合物是一类能够在机体内引起一定生物学效应的物质的总称，是小分子药物的主要来源。这类化合物一般比较容易透过细胞膜，作用于细胞内特定的靶蛋白，调控细胞内信号通路，进而引起细胞表型的一些变化。MCE收录了8700多种具有明确报道的、活性已知、靶点明确的小分子化合物，包括天然产物，新型化合物，已上市化合物及处于临床期化合物等，可以用于信号通路研究，新药研发，老药新用等不同的筛选目的。
临床药物库: https://www.medchemexpress.cn/screening/Clinical_Compound_Library.html
新药研发是一个耗时且成本高昂的研发过程。与新药研发相比，药物再定位 (也称为老药新用)
具有很多优势。首先，降低了药物研发失败风险；其次，可以缩短研发周期；最后，降低研发成本。批准上市药物及通过临床I期的化合物由于具有良好的生物活性、药代动力学特性和安全性，特别适合老药新用的研究，可以显著加快药物开发进程。
中药单体化合物库：https://www.medchemexpress.cn/screening/traditional-chinese-medicine-monomer-library.html
天然产物是自然界中产生的，来自于任何生物体的小分子化合物，也包括初级代谢物及次级代谢物。天然产物具有潜在的生物活性，可以作为药物发现的先导化合物，用于商业开发。随着化合物靶点的开发，对筛选化合物多样性的需求越来越大。通过对自然界生物多样性的持续研究，其中许多生物多样性仍有待开发，天然产物将在满足这一需求方面发挥关键作用。
中草药是中药的重要组成部分，在中国，中药被认为是许多急慢性疾病的基本治疗方法，已经有上千年的使用历史。许多研究表明，中药通过多成分、多靶点网络对机体发挥整体调控作用。中药单体是中草药中的活性成分，具有多种药用特性，如抗氧化，抗癌，抗菌等作用，是新药开发的重要来源。
二、化合物库使用方法及使用注意事项
化合物库筛选过程主要包括化合物库选择、实验方案设计、实验进行、实验结果检测、实验方案优化等步骤。
进行化合物库筛选，要根据自己的实验目的选择合适的化合物库，设计适合的实验方案，并设计好化合物作用结果的检测指标及检测方法。化合物库筛选的实验方案设计至少需要包括以下几个要素：①重复孔设置；②浓度/时间梯度设置；③对照组设置等。其中对照组设置又包括阳性对照（已有文献报道可以达到实验目的的化合物）、溶剂设置（根据化合物库中化合物的溶剂情况，设置不同的对照，理论上每种溶剂均需要设置对照）、空白对照等。按照设计好的实验方案进行实验，第一轮筛选得到初步的阳性结果之后，还可以根据具体的研究目标对实验方案或筛选到的化合物进行优化。
图4. 化合物筛选实验设计示意图
三、MCE化合物库优势
基于化合物库筛选的研究成果高效持续
基于化合物库筛选的研究课题，通常可以借助高通量的筛选平台，可大大提高课题进展的速度。而且，由于采用了化合物库筛选的研究课题通常是更加具有系统性的工作，因此得到的研究成果的质量也相对较高。据统计，近三年来采用MCE化合物库发表的文章平均影响因子约为7.64。此外，基于筛选化合物库筛选进行的研究课题更加具有持续性，可支持多篇学术论文的发表。
化合物库种类齐全，化合物库中产品种类多样
作为全球领先的科研化学品和生物活性化合物供应商，MCE可提供60多种活性化合物库，总计10000+具有生物活性的小分子化合物，可用于高通量筛选 (HTS)和高内涵筛选 (HCS)，是进行新药筛选和新适应症发现等研究的专业工具。
MCE提供的化合物库基本涵盖了热门的研究领域（肿瘤、干细胞、神经、表观遗传等）、信号通路（TGFβ、mTOR、NF-κB等）及蛋白靶点（激酶、GCPRs，离子通道等）并包含多种上市及处于临床期药物、天然产物及具有特定结构的化合物。此外，为了满足所有科研工作者的个性化需求，MCE还可以提供化合物库定制服务，定制范围包括化合物种类、化合物规格、化合物库包装形式等。
先进的化合物库管理系统
为了解决大量活性分子的综合管理问题，MCE建立了高效的管理平台。该平台紧跟国际新药创制的前沿方向，按照我国生物医药产业的发展战略，采用新型的管理模式，通过建立大规模化合物样品库发展、管理、维护和使用规范，服务于我国创新药物的研究和开发。
该平台保证MCE在研发过程的化合物库中活性分子数目的持续更新，生产和存储过程化合物的质量控制，对数目庞大的活性分子进行有效分类以及对活性分子相关信息（药效药理数据等）的集成与管理。
400万+化合物
小分子药物虚拟筛选中，化合物库“越大越好”；但也需考虑化合物合成问题，这样才能避免“筛到买不到”的窘境。MCE与Enamine、LifeChemicals、Chemspace强强联合，可提供400万+有库存、结构多样、具有类药性的化合物及38种化合物库。化合物库包括蛋白-蛋白相互作用库、靶向RNA的小分子库、结构新颖且多样性丰富的多样性库、共价化合物库、靶点库 (GPCR、激酶、离子通道等)等等。
| Cat. No. | Product name | Format/Size | Descriptions |
| HY-L0051V | HTS Compound Library | 2,121,382.00 | Enamine HTS Collection contains 2,121,382 diverse screening compounds. These compounds frequently have unusual structures and unique properties. The collection is particularly recommended for the researchers looking for most diverse screening set. |
| HY-L0052V | Advanced Library | 482,182.00 | Enamine Advanced Collection contains 482,182 compounds that have lead-like properties with MW ≤ 350, ClogP ≤ 3, and RotBonds ≤ 7 and/or valuable pharmacophores such carboxylic, primary amino and amide groups. |
| HY-L0053V | Premium Library | 43,525.00 | Enamine Premium Collection contains over 43,525 compounds having most favorable molecular properties (high Fsp3, low logP and MW). |
| HY-L0072V | Agro-like Library | 10,240.00 | Library of compounds intended for use in agro/crop science. |
| HY-L0073V | Antiviral Library | 3,933.00 | Designed for discovery of new Nucleoside-like antivirals |
| HY-L0091V | Chemspace Lead-Like Compound Library | 981,244.00 | Chemspace Lead-Like Compound Library contains 981,244 in-Stock lead-like compounds with favorable physicochemical profiles and high Quantitative Estimation of Drug-likeness. |
| HY-L0065V | CNS Library | 38,080.00 | Library of novel small molecules with high CNS MPO scores. |
| HY-L0076V | Covalent Screening Library | 14,249.00 | A set of screening compounds bearing “warheads” for covalent target modification. |
| HY-L0054V | Discovery Diversity Set 10 | 10,560.00 | Enamine Discovery Diversity Sets (DDS) are high-quality compound libraries focused on novel chemotypes and non-trivial structures. They compose of DDS-10 (10,560 compounds) and DDS-50 (50,240 compounds) sets which do not overlap. Discovery Diversity Set 10 contains 10,560 diverse screening compounds. |
| HY-L0055V | Discovery Diversity Set 50 | 50,240.00 | Enamine Discovery Diversity Sets (DDS) are high-quality compound libraries focused on novel chemotypes and non-trivial structures. They compose of DDS-10 (10,560 compounds) and DDS-50 (50,240 compounds) sets which do not overlap. Discovery Diversity Set 50 contains 50,240 diverse screening compounds. |
| HY-L0077V | DNA Library | 5,530.00 | Designed for identification of new actives against proteins essential for DNA stability. |
| HY-L0078V | Epigenetics Library | 9,353.00 | Library of compounds focusing to hit on a number of epigenetic targets. |
| HY-L0058V | GPCR Library | 54,080.00 | Designed for discovery of new GPCR ligands. |
| HY-L0056V | Hit Locator Library 300 | 300,115.00 | Enamine Hit Locator Library (HLL) is a sizable highly diverse screening set of 300,115 novel screening compounds. |
| HY-L0067V | Immuno-Oncology Library | 52,935.00 | Designed for discovery of novel hits in Immuno-Oncology therapeutic area. |
| HY-L0064V | Ion Channel Library | 36,800.00 | Designed for discovery of new Ion Channels ligands. |
| HY-L0061V | Kinase Library | 64,000.00 | Designed for discovery of novel protein kinase inhibitors. |
| HY-L0088V | Life Chemicals 50K Diversity Library | 50,240.00 | Life Chemicals 50K Diversity Library contains 50,240 diverse screening compounds. |
| HY-L0087V | Life Chemicals HTS Compound Collection | 465,800.00 | Life Chemicals HTS library is a unique collection contains 465,800 diverse screening compounds for the lead identification via high-throughput screening (HTS) and high content screening (HCS). |
| HY-L0082V | Nucleoside Mimetics Library | 290.00 | A set of Nucleoside Mimetics. |
| HY-L0066V | Protein-Protein Interaction Library | 40,640.00 | Designed for discovery of novel PPI inhibitors. |
| HY-L0084V | RNA Library | 8,960.00 | Library of compounds capable of binding to RNA. |
| HY-L0086V | Specs HTS Compounds Library | 210,070.00 | Specs HTS library is a unique collection contains 210,070 diverse screening compounds for the lead identification via high-throughput screening (HTS) and high content screening (HCS). |
注：
1、每个库中的分子数量实时变动，以上分子数量仅供参考，以官网实时数据为准。
2、更多数据库详见MCE官网。
产品推荐：
生物活性化合物库
（https://www.medchemexpress.cn/screening/Bioactive_Compound_Library.html）
生物活性化合物是一类能够在机体内引起一定生物学效应的物质的总称，是小分子药物的主要来源。这类化合物一般比较容易透过细胞膜，作用于细胞内特定的靶蛋白，调控细胞内信号通路，进而引起细胞表型的一些变化。MCE收录了8700多种具有明确报道的、活性已知、靶点明确的小分子化合物，包括天然产物，新型化合物，已上市化合物及处于临床期化合物等，可以用于信号通路研究，新药研发，老药新用等不同的筛选目的。
临床药物库: https://www.medchemexpress.cn/screening/Clinical_Compound_Library.html
新药研发是一个耗时且成本高昂的研发过程。与新药研发相比，药物再定位 (也称为老药新用)
具有很多优势。首先，降低了药物研发失败风险；其次，可以缩短研发周期；最后，降低研发成本。批准上市药物及通过临床I期的化合物由于具有良好的生物活性、药代动力学特性和安全性，特别适合老药新用的研究，可以显著加快药物开发进程。
中药单体化合物库：https://www.medchemexpress.cn/screening/traditional-chinese-medicine-monomer-library.html
天然产物是自然界中产生的，来自于任何生物体的小分子化合物，也包括初级代谢物及次级代谢物。天然产物具有潜在的生物活性，可以作为药物发现的先导化合物，用于商业开发。随着化合物靶点的开发，对筛选化合物多样性的需求越来越大。通过对自然界生物多样性的持续研究，其中许多生物多样性仍有待开发，天然产物将在满足这一需求方面发挥关键作用。
中草药是中药的重要组成部分，在中国，中药被认为是许多急慢性疾病的基本治疗方法，已经有上千年的使用历史。许多研究表明，中药通过多成分、多靶点网络对机体发挥整体调控作用。中药单体是中草药中的活性成分，具有多种药用特性，如抗氧化，抗癌，抗菌等作用，是新药开发的重要来源。
