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胸腺DNA的制备

2019.4.18

实验概要

本实验介绍了浓盐法小牛胸腺DNA制备的原理及操作步骤。

实验原理

DNA在生物体内是以与蛋白质形成复合物的形式存在的,因此提取出脱氧核糖核酸蛋白复合物(DNP)后,必须将其中的蛋白质除去。小牛胸腺,鱼类精子和植物种子的胚等含有丰富的DNA,可作为提取DNA的良好材料。动物和植物组织的脱氧核糖核蛋白可溶于水或浓盐溶液(如1mol/L氯化钠溶液),但在0.14mol/L盐溶液中的溶解度很低,而核糖核蛋白(RNP)则溶于0.14mol/L盐溶液中,利用这一性质可将脱氧核糖核蛋白与核糖核蛋白以及其他杂质分开,当核蛋白与氯仿一起振荡时,蛋白质变性而与核酸分开,核酸继续保留于水相中,再用乙醇将水相中的DNA沉淀出来。为除去DNA制品混杂的RNA,可用核糖核酸酶处理。大部分多糖在用乙醇或异丙醇分级沉淀时即被除去,如需要还可以进一步通过柱层析或电泳加以纯化。

主要试剂

1. 0.1mol/L氯化钠-0.05mol/L,pH 7.0柠檬酸钠缓冲溶液:先配制0.05mol/L,pH=7.0柠檬酸钠缓冲溶液,然后将氯化钠溶于此缓冲溶液中,使其最终浓度达到0.1mol/L。

2. 10%氯化钠溶液;

3. 氯仿-异戊醇混合液(体积比为9∶1);

4. 95%乙醇及无水乙醇。

主要设备

1. 组织捣碎机

2. 离心机

3. 玻璃匀浆器

实验材料

小牛胸腺

实验步骤

1. 取新鲜(或冰冻)的小牛胸腺,除去血水和结缔组织,在冰浴上切成小块,称取20g,加入2倍体积的0.1mol/L氯化钠-0.05mol /L,pH=7.0柠檬酸钠缓冲溶液,于组织捣碎机上高速匀浆5分钟。

2.  组织糜用转速为3000r/min的离心机离心15分钟,将沉淀用50  mL上述缓冲溶液洗涤2次,洗涤时用匀浆器研磨洗涤,每次如前离心。向最后得到的细胞核沉淀中加入6倍体积的10%氯化钠溶液,充分搅匀置冰箱中过夜,以充分提取DNP,溶液为粘稠状。将所得的半透明粘稠状液体,用滴管慢慢注入冷蒸馏水中,边加边轻轻搅动(NaCl的最终浓度为0.14mol/L),这时有白色丝状物-核蛋白析出,在冰箱中静置数小时,收集沉淀。将沉淀物再溶于4倍体积的10%氯化钠溶液中,迅速搅拌以加速溶解。加入1/2体积的氯仿-   异戊醇混合液,剧烈振荡5分钟左右,用转速为3000r/min的离心机离心15分钟,得三层:上层为含有DNA和DNA核蛋白的水层,下层为氯仿-异戊醇的有机溶剂层,变性蛋白质介于两层之间。

6. 吸出上面的水层,再用氯仿-异戊醇如前进行脱蛋白,直至界面处不再出现变性蛋白质为止。

7. 最后吸出上清液并将其注入两倍体积的95%乙醇中,用玻璃棒搅起白色纤维状DNA沉淀,沥干,用80%乙醇洗涤,最后用少量无水乙醇洗涤。尽量沥干乙醇后,铺开在表面皿上。置于真空干燥器内干燥,即得白色纤维DNA钠盐。

注意事项

1. 由于DNA主要存在于细胞核中,为了便于提取DNA,应严格控制胸腺破碎的条件,既要将细胞膜破碎,又要尽可能避免细胞核被破坏,导致DNA释放而被断裂。

2. 在用氯仿-异戊醇除去组织蛋白时,要剧烈振荡使蛋白变性。若振荡不够,蛋白质不能很好除去,则影响DNA制品的质量


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