关注公众号

关注公众号

手机扫码查看

手机查看

喜欢作者

打赏方式

微信支付微信支付
支付宝支付支付宝支付
×

关注前沿测序技术

2007.7.19

而在蛋白质测序方面,《The Scientists》杂志回顾了一下研究进展,文中提到,上个世纪70年代的生化学家在钻研细胞信号传递、循环和粘附的蛋白化学特征时遇到两个难题:高精度纯化蛋白和提纯低分子量蛋白。

比如,在人类破译干扰素结构之前的20多年中,很难对其进行纯化;血管紧缩素II(angiotensin II ,8个氨基酸)和抗利尿激素后叶加压素(vasopressin,9个氨基酸)等小分子,产生令人难以破译的蛋白信号。

生化学家不断提高连接、切割、提取和测序肽段的灵敏度。1950年,Pehr Edman设计出一种测序氨基酸的化学降解过程,并于1967年设计出相应的自动“测序仪”。波士顿大学Richard Laursen于1971年通过将样品固定在树脂支承上,对改良Edman设备。这种模型能够用于分析小肽,但过程中的液体溶剂会破坏样品,使稀有和分子量低的肽很难被捕捉到。

1977年,加利福尼亚理工学院生化学家William J. Dreyer发明出这里我们所见到的测序仪器。他们为玻璃管(Glass Cartridge)反应器配备了大孔性支承以固定肽段。液体和气体试剂如苯异硫氰酸酯(phenylisothiocyanate)和三甲胺 (trimethylamine)气体,流过反应室与肽链的末端残基集合。经过洗涤后,气态形式的三氟乙酸(Trifluoroacetic Acid)切下残基,切下部分被苯萃取。烘干阶段,惰性气体(氮气)辅助预防样本丢失。该设备非常灵敏,几乎能计数离子。

附:

吉布斯取样法(Gibbs sampler, GS)

Best等提出了一种更为通用的分析群体数据的方法,它可应用于较广范围的复杂模型而同时却没有诸如NONMEM法中的某些限制。此法并不需要计算出确切的或近似的参数估定值,而是通过一种称为Gibbs sampling的计算法对所感兴趣的参数给出一系列模拟值,这些值可用来重新组成每一参数的概率,或进行适当简化以提供确切值或某个范围的数值。

推荐
关闭