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三代测序的前奏:Illumina再诉牛津纳米孔

2016.2.24

  Illumina今天正式宣布起诉Oxford Nanopore,诉讼涉及后者在纳米孔测序相关领域涉嫌侵犯Illumina两项ZL。

  Illumina同时向美国国际贸易委员会和美国南加州地方法院提出此次诉讼,起诉Oxford Nanopore侵犯其美国ZL局第8673550号和9170230号ZL,这两个ZL的所有权授予相关公司与机构应用与转化MSP纳米孔及相关技术。作为这两项ZL的所有者,Illumina公司仅独家授权阿拉巴马大学、伯明翰研究基金会以及华盛顿大学使用该技术。

  根据相关文件,这两项ZL与耻垢分枝杆菌孔蛋白A(MspA)的应用密切相关,而MspA作为一种天然纳米孔蛋白通常作为纳米孔测序技术的基础。2010年,华盛顿大学Jens Gundlach团度在历史上首度阐明了MspA可用于纳米孔测序。随后,该团队与阿拉巴马大学微生物学家Michael Niederweis?合作阐明了MspA与“棘轮体系”(ratcheting system)的整合系统能够精确读取短DNA序列并进一步完成了该项成果的技术转化。

  在起诉文件中,Illumina表示这项诉讼将主要针对Oxford Nanopore的MinIon与PromethIon系统。

  作为一种手提式纳米孔测序设备,牛津MinIon已经完成商业化。而作为MinIon升级版本的PromethIon系统尚未上市。

  根据已有消息,牛津纳米孔技术公司尚未披露关于其蛋白纳米孔测序技术的任何信息。而在Gundlach团队发现纳米孔蛋白MspA之前,主流的蛋白纳米孔技术主要通过α-溶血素蛋白实现。

  Illumina公司拒绝对此案发表评论,尤其对于Illumina是否曾授权Oxford Nanopore在其设备中应用MspA及相关技术Illumina未做任何答复。

  根据相关消息,这次诉讼并不是Illumina与Oxford Nanopore的第一场官司,两公司早在2009年便展开了一场关于Oxford Nanopore核酸外切酶纳米孔测序策略商业化的诉讼。当年,Oxford Nanopore作为败诉者放弃了在其MinIon与PromethIon系统中应用核酸外切酶纳米孔测序策略,同时也使得两家公司中止了他们的商业协议。

  关于纳米孔测序技术:纳米孔测序法是采用电泳技术,借助电泳驱动单个分子逐一通过纳米孔来实现测序的。由于纳米孔的直径非常细小,仅允许单个核酸聚合物通过,因而可以在此基础上使用多种方法来进行高通量检测。此外,纳米级别的孔径保证了检测具有良好的持续性,所以测序的准确度非常高。对于长达1,000个碱基的单链DNA分子、RNA分子或者更短的核酸分子而言,根本无需进行扩增或标记就可以使用纳米孔测序法进行检测,这使得便宜、快速地进行DNA测序成为可能。如果对现有纳米孔测序法进行进一步发展和改进,那么它将有望成为第三代测序技术(也可称为下下一代测序技术),从而帮助人们实现24小时内只花费1,000美元完成二倍体哺乳动物基因组测序这一目标。

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