在大多数严重的急性呼吸道感染病例中,RNA病毒是主要病原体,如2019年12月以来的新冠病毒(SARS-CoV-2),已导致全球超过400万人感染,超过30万名患者死亡[1,2]。mNGS因无需培养、不依赖核酸序列、无偏好广覆盖的优点,在临床疑似新发病原体、罕见病原感染、急危重症、未知原因发热等患者病原检测应用有较多案例报道,国内专家共识推荐使用[3]。但是这种实验室自建检测方法由于缺乏方法标准化和实验室分析性能和临床性能的确认,阻碍了该方法在临床的应用普及[4]。

来源:medRxiv

  首都医科大学陈德喜教授团队基于illumina Nextera XT Tn5转座酶直接切割RNA/DNA杂合链的特性[5],优化mNGS建库方法,并在NextSeq 500平台上对该方法在临床检测呼吸道RNA病毒的各项性能指标进行了确认,包括低检测限、精密度、稳定性、抗干扰能力以及SARS-CoV-2病毒检测准确性等,为mNGS临床实验室常规检测应用提供了数据参考和支持。5月14日,该研究成果发表在预印本medRxiv上[6]。