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CASMS分论坛:多组学整合与大数据

2021.8.17

  分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在13日“Multi-omics Integration and Big Data”分论坛中,哈沃德医学院Steven Gygi博士、太平洋西北国家实验室(PNNL)Weijun Qian博士、贝勒医学院Bing Zhang博士、上海药物研究所Minjia Tan博士、圣裘德儿童研究医院Junmin Peng博士带来精彩报告。分析测试百科网作为大会支持媒体,为您带来全程跟踪报道。

  报告人:哈沃德医学院Steven Gygi博士

  报告题目:The BioPlex Networks: Proteome-Wide Protein-Protein Interaction Networks in Two Cell Line

  报告介绍了一个强大的高容量AP-MS平台,并用它创建了两个细胞系特异性的人类相互作用组蛋白质组图谱。这两个图谱极大地扩展了对人类蛋白质相互作用的理解,揭示了成千上万种新的蛋白质相互作用。两个图谱之间共享的交互作用定义了一个高置信度、实验复制的核心人类交互组模型。细胞系特异性相互作用倾向于反映每个细胞系的独特生物学特性,同时增加人们对蛋白质相互作用景观的理解范围。

  无论是单独观察还是共同观察,细胞系特异性人类相互作用组蛋白质组图谱为人类蛋白质组组织提供了独特而有力的见解。

  报告人:太平洋西北国家实验室(PNNL)Weijun Qian博士

  报告题目:Discovery of Autoimmune Signatures of Progressive Pancreatic Beta Cell Dysfunction in a Pre-Symptomatic Type 1 Diabetes Patient Using Single Islet Proteomics

  近单细胞或空间组学工具可能在询问早期疾病组织中的细胞异质性方面发挥重要作用。

  目前对T1D前供体进行的供体内胰岛异质性研究说明了这种方向的潜力。

  总体数据仍处于初步阶段。需要更多捐赠者的数据才能对T1D进展进行更全面的分析。

  报告人:贝勒医学院Bing Zhang博士

  报告题目:Proteogenomics Drives Therapeutic Hypothesis Generation for Precision Oncology

  报告指出综合通路特征为靶向治疗和免疫治疗提供了新的见解;蛋白质组学分析能够系统鉴定癌症相关蛋白和磷酸化位点;蛋白质基因组整合优先考虑拷贝数驱动因素和新抗原候选。

  报告人:、上海药物研究所Minjia Tan博士

  报告题目:Integrative Proteomic Characterization of Tumor Samples Identifies New Therapeutic Opportunities

  肺腺癌(LUAD)和肺鳞状细胞癌(LUS)是非小细胞肺癌的主要类型。LUAD约占肺癌的50%,对非吸烟患者的诊断大幅增加。LUAD治疗面临的挑战有无靶向治疗、靶向治疗中的原发性/获得性耐药、早期诊断和治疗困难。

  报告介绍了早期LUAD的蛋白质组学特征等。研究指出综合多组学分析更好地反映扫描生物学和临床教学,靶向蛋白PTM串扰可能是一种有效的治疗方法。

  报告人:圣裘德儿童研究医院Junmin Peng博士

  报告题目:The Proteomics Landscape of Alzheimer's Disease

  Alzheimer's Disease是最常见的痴呆症,美国第六大死因。目前美国有580万AD患者,到2050年全世界将有1亿。2020年护理成本为3050亿美元。神经退行性疾病中有蛋白质聚集,蛋白质组学是Alzheimer's Disease的关键。

  报告介绍了AD中的剪接功能障碍、AD病例的蛋白质组分析、改变蛋白质/基因的优先顺序、AD发病机制:平衡模型等。

  关于Multi-omics Integration and Big Data的演讲人介绍,请见:http://casms.org/?action=content&id=62

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