梅奥诊所通过靶向测序诊断短端粒综合征
短端粒综合征（STS）是指一系列加速衰老的综合征。顾名思义，它们由基因突变导致端粒缩短而引起。细胞更新较快的器官，如皮肤、骨髓、肺和胃肠道，通常受到影响。梅奥诊所（Mayo Clinic）的研究人员近日利用靶向基因组学方法来寻找与疾病相关的基因突变。
梅奥诊所血液科的Mrinal Patnaik以及肺和重症监护医学部的Mark Wylam带领团队，完成了这项研究，并将结果发表在《Mayo Clinic Proceedings》上。“在一系列患者的帮助下，我们证明了利用靶向基因组学方法来鉴定新颖遗传异常的潜力，并前瞻性地随访这些患者。”
研究人员对17名短端粒综合征患者的数据进行回顾性分析，这些患者的诊断过程包括利用荧光原位杂交来测量端粒长度，并利用靶向测序来分析8个STS相关基因。对于那些未携带已知变异的患者，研究人员还采用外显子组测序来搜索可疑的生殖系改变。
“我们的标准方法包括彻底的病史调查和体格检查，然后是测量端粒长度和开展靶向NGS检测，”作者写道。“如果上述检测结果为阴性，则由临床医生、生物信息学家和分子生物学家组成的多学科专家组将在讨论后开展全外显子组测序。”
利用这一策略，研究小组追踪了6名STS患者端粒复合物基因中的变异，包括TRET、TREC和DKC1基因中的4个已知的致病变异，以及TERT和RTEL1基因中的2个意义不明的变异。他们根据DKC1或TERC变异的存在以及与STS相关的临床表型，诊断出3个病例。
尽管他们成功检测到STS的一些贡献因素，但是Patnaik、Wylam及其他作者指出，“目前只有少量的人类基因被鉴定出，这表明还需要利用精确基因组学的方法来鉴定端粒长度调控的遗传和表观遗传机制”。
同时，当他们检查在梅奥诊所诊断出的17个STS病例的临床特征时，研究人员发现12名患者（71%）患有特发性间质性肺炎，5名患者患有不明原因的血细胞减少症，还有2名患有肝硬化。
基于这些结果，研究人员得出结论，短端粒综合征患者存在多种临床表现，需要采用多学科管理方法，而器官特异性移植能够带来临床上的收益。
约翰•霍普金斯大学的肿瘤学研究人员Mary Armanios在同期杂志的一篇社论中指出，新研究中包含的回顾性病例突出了整合分子检测以及鉴定那些分子病理相同但临床表现不同的患者的机遇和挑战。
