DNA的测序技术-3
(二):测序胶的制备
1:玻璃板的处理
A,长板(不带凹槽、反硅化处理,粘胶板)
a,2N NaOH浸泡1小时以上,自来水冲洗,海绵或软布蘸洗涤剂将板清洗干净,自来水冲洗掉全部洗涤剂,无离子水中过三遍,晾干。b,
在1ml95%乙醇,0.5%冰乙酸中加入5μl粘合硅烷。c,
用b中所配溶液浸透薄棉纸,用此薄棉纸均匀擦拭玻璃板d,晾干后,用95%乙醇单向擦拭该板,然后略微用力沿垂直方向擦拭该板。重复3此这一乙醇擦拭过程。
B:短板(带凹槽、硅化处理,不粘胶板)
a,海绵或软布蘸洗涤剂将板清洗干净,自来水冲洗掉全部洗涤剂,无离子水中过三遍,晾干。b,用硅化液浸透的薄棉纸均匀擦拭该板。c,晾干后,用薄棉纸擦掉多余的硅化液。
2,按图将两块玻璃板及夹条安装好。
3,制胶 6%的变性胶
Acr/Bis 19:1 ,
尿素 8M
Tris 90mM
硼酸 90mM
EDTA 2mM
TEMED(%) 0.05
抽气 4℃保存
临用前按400μl/75ml预混液的比例加入过硫酸氨(100mg/ml)
4:灌胶
(三):电泳
1,胶凝后,插入鲨鱼齿,
2,将Ⅰ中制备好的样品在90℃加热2分钟
3,加样,电泳,维持2000伏以上恒压(在加样前,同样电压预电泳),直至指示剂跑到胶下沿。
电极缓冲液为1×TBE。
(四):银染
1,电泳结束后,橇开板,将附着胶的一块板置于固定/终止液中浸泡过夜或震荡30分钟,直至指示染料消失。
2,凝胶洗涤,用超纯水震荡洗涤胶3次,每次2分钟,凝胶板从水中取出后,竖起控水10-20秒。