2000年7月25日，法国航空公司的协和飞机于巴黎戴高乐机场附近发生空难，113人罹难。法航停飞所有协和飞机，适航证被收回。

　　尽管在重新改造了机体缺陷后，技术上已过关，协和飞机重获适航证书，但或许民众因空难产生了巨大的心理落差，协和的声望已大不如前。此时诸项问题渐渐浮上水面。

　　首先是无法解决作为超音速飞机所固有的音爆问题。在协和出现以前，只有少数军用飞机可突破音速，因而人们并不了解音爆。但协和飞机在突破音障时也发生音爆，因此被禁止在陆地上进行超音速飞行；另外，以当时巴黎至纽约往返机票价格为例，协和飞机售价9000美元，比普通客机的头等舱还贵25%。

　　音爆带来的掣肘与高昂的营运费用合在一起，几乎直接断送了这种飞机的生命。协和飞机一共建造了20架，到2003年4月，尚有12架在进行商业飞行。2003年10月24日，协和飞机执行了最后一次航班后全部退役，从此天空中再也寻觅不到超音速客机的身影。