关注公众号

关注公众号

手机扫码查看

手机查看

喜欢作者

打赏方式

微信支付微信支付
支付宝支付支付宝支付
×

副溶血性弧菌的PCR检测的介绍

2022.8.22

  用于检测V.p的PCR方法主要有任意引物PCR(abritrarilyprimedPCR,Ap-PCR)、针对任意引物PCR、多重PCR(muhiplex-PCR)、实时PCR(Real-timePCR)。

  1、任意引物PCRMatsumoto等采用任意引物PCR对V.p进行检测。他们针对V。p的tdh基因和trh基因一段特异的序列,设计两条引物,

  引物1:5--GGTGCGGGAA--3,

  引物2:5一GTTTCGCTCC一3,

  对1977~1998年所收集的227株V.p进行PCR。通过电泳分析发现,1996-1998年收集的22株血清型为03:K6菌株与1996年以前收集的03:K6血清型菌株基因序列有所不同,为03;K6血清型新出现的变异株,并最初出现在孟加拉国。这是目前最简单的以基因为基础的细菌亚分型方法。

  2、针对任意引物PCR由于临床分离株绝大多数含有tdh基因,因此绝大部分研究者都根据tdh设计引物进行特异扩增。1993年,Lee等根据tdh基因设计引物,对36株TDH+株、89株TDH-株以及46株其他弧菌和肠道菌进行PCR检测。结果显示,36株TDH+株全部特异扩增出来,其余菌株都没有扩增;而检测灵敏度高,最低检测量可至40pgDNA,并可直接检测粪便标本,无需分离培养,方便快速。1999年,Kim等选择toxR基因序列设计两对引物,5’--GTCTTCTGACGCAATCGTTG--3和5’一ATACGAGTGGTTGCTGTCATG一3’,对14株V.p、14株其他弧菌进行PCR。结果显示,14株V.p都得到一条368bp的特异扩增亮带,而其他菌株没有特异扩增。此外,Venkateswaran等选择gyrB基因设计引物对V·p进行PCR、Cordova等选择pR72H基因设计引物进行PCR,特异性、灵敏度都很好。

  3、多重PCR由于不是全部副溶血性弧菌都含;tdh基因或,trh。基因,所以只针对tdh或trh的单一PCR,有时会漏检。多重PCR(multiplex-PCR)能全方位高效率地检测Vpo1994年,Bej白等针对“、tdh、trh设计不同的引物对,在同一PCR反应体系内同时扩增tl、tdh、trh。结果显示,所有的V。p都扩增出“基因,tl基因是V.p特异的;54%的V.p扩增出tdh基因;只有38.73%的V.p扩增出trh基因;该法灵敏度高,能把log牡蛎培养肉汤里10~100个V.p检测出来。与其他常规生化方法相比,多重PCR更快速,仅8h就能完成检测,结果更为准确、可靠,而且还可改进成定量竞争PCR,对标本中靶序列进行定量。

  4、实时PCR常规PCR检测,需要从反应体系中吸取产物做电泳或Southern杂交等试验进行鉴定,转移过程中易污染,造成假阳性,而且耗费时间。1996年,Tyagi开创了一种实时PCR(Real-timePCP,)。实时PCR是在,PCR反应体系中加入标记有报告基团和淬灭基团的线性Taqman。探针或茎环型荧光分子信标探针,在墓因扩增过程中,与产物杂交,此时,报告基团和淬灭基团分开,根据能量共振转移现象,报告基团发出荧光而被检测。这种方法操作简单,闭管检测,减少污染,灵敏度高,并且可以在PCR结束或PCR过程进行同步定性或定量检测,面且可以进行临床大规模快速检测。

推荐
关闭