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PCR技术的循环参数的介绍

2022.3.09

  1、预变性

  (Initial denaturation)

  模板DNA完全变性与PCR酶的完全激活对PCR能否成功至关重要,建议加热时间参考试剂说明书,一般未修饰的Taq酶激活时间为两分钟。

  2、变性步骤

  循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列完全变性,可能的情况下可 缩短该步骤时间

  变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败。

  3、引物退火

  (Primer annealing)

  退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的Tm值为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后在此次实验基础上做出预估。

  退火温度对PCR的特异性有较大影响。

  4、引物延伸

  引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略

  延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生设定为1min/kbp。

  5、循环数

  大多数PCR含25-35循环,过多易产生非特异扩增。

  6、最后延伸

  在最后一个循环后,反应在72℃维持10-30分钟.使引物延伸完全,并使单链产物退火成双链。

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