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董梦秋、贺思敏Nature Methods发表重要成果

2015.2.11

  蛋白交联是一种特殊的翻译后修饰,在所有生命中起到了基础性的作用,包括建立细胞外基质、调控蛋白在细胞内外的功能或半衰期等。内源蛋白质交联有很多种形式,从相当普遍的二硫键或异肽键,到胶原和弹力蛋白中的特殊连接。

  二硫键是许多分泌蛋白必不可少的部分,比如激素、生长因子和细胞表面受体。但分析二硫键一直是个难题。为了精确鉴定通过二硫键相连的多肽,北京师范大学、北京生命科学研究所、中科院计算技术研究所等单位的研究人员开发了一个高通量的质谱方法pLink-SS。这一成果发表在二月九日的Nature Methods杂志上,文章的通讯作者是董梦秋(Meng-Qiu Dong)研究员和贺思敏(Si-Min He)研究员。

  研究人员以质谱(MS)为基础建立了一个在单个或复杂蛋白质样本中获得二硫键图谱的新方法,包括自动化数据分析和错误发现率(FDR)控制。

  现在的医药产业亟需一种新工具来分析单克隆抗体中的天然二硫键。研究人员用自己的方法对一个单克隆抗体进行了分析,在可变区鉴定了两种未知二硫键(一个在重链一个在轻链)。为了验证这一方法的有效性,研究人员还将十种标准蛋白混合起来分析。他们通过多重蛋白酶消化,成功获得了所有74个二硫键的图谱。

  除此之外,研究人员还进行了蛋白质组水平上的二硫键图谱分析,在大肠杆菌中鉴定了199个二硫键,在人类内皮细胞分泌的蛋白中鉴定了568个二硫键。研究显示,二硫键不仅是一种结构元件,还有着催化和调控功能。许多二硫键涉及了金属结合的半胱氨酸残基,形成这样的二硫键会去除金属离子,改变蛋白质的构象。

  作者简介:

  董梦秋 博士 北京生命科学研究所研究员

  教育经历:2001年 耶鲁大学分子生物物理学与生物化学系博士;1995年 中国科学院上海生物化学研究所硕士;1992年 四川大学生物系学士

  工作经历:2007年 -北京生命科学研究所研究员;2003-2007年 美国斯克利普斯研究院博士后;2001-2003年 美国加洲大学圣地亚哥分校医学院博士后

  贺思敏 研究员

  1986年9月-1991年7月,清华大学,计算机科学与技术专业,学士毕业; 1991年9月-1997年7月,清华大学,计算机科学与技术专业,博士毕业; 1997年8月-2002年6月,国家智能计算机研究中心-摩托罗拉联合实验室,北京算通科技发展有限公司; 2002年7月- 中国科学院计算技术研究所。

  研究方向: 应用算法学,生物信息学,信息检索。

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