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你知道单细胞分析在研究细胞异质性有哪些手段么

2021.9.26

 单细胞分析是研究细胞异质性的有效手段

    研究细胞异质性的关键就在于能否实现对单个细胞进行较多参数的分析,这就是“单细胞分析(single cell analysis)”的概念。事实上,自从“细胞”学说被提出后,人类一直在努力寻求分析单个细胞的技术方法。但是,单细胞分析有一个巨大的挑战,那就是样品量及其有限,一个典型的人类细胞仅含有约6.6pg DNA、10pg总RNA。

  从如此有限的样品中获取大量精确的数据无疑是一个巨大的挑战。 所以,传统的高通量分析手段例如基因组学、转录组、蛋白质组学等,往往只能基于大量细胞进行分析,得到的也是大量细胞的平均信息;而一些可以针对单细胞进行分析的方法,例如免疫荧光、流式细胞术等,也会受到通道的限制,仅仅对少数几种蛋白进行分析,同样无法深入分析其异质性。

    直到近几年,随着相关领域的一系列技术突破,“单细胞分析”的概念才真正得以实现。两类技术在这过程中起到了先导作用,首先是测序技术的进步,以illumina为代表的第二代测序技术大大降低了测序成本,使在一个实验中对多个样本测序成为可能;其次,一些可以用于单细胞核酸样本的扩增技术(例如MDA扩增基因组,SMART、TargetAmp可以扩增转录组)的开发,解决了单细胞核酸样品量少的问题。

  这两类技术的结合,实现了对单细胞基因组和转录组的测序,开创了组学的重要分支:单细胞基因组学(single cell genomics)和单细胞转录组学(single cell transcriptomics)。后来,随着基于微流体芯片技术的C1单细胞全自动实验系统和Biomark HD(Fluidigm)的广泛应用,单细胞分析开始向自动化、更多细胞通量的方向发展。

    与此同时,新的单细胞蛋白质检测技术也不断涌现。其中,比较有代表性的就是质谱流式技术(Mass Cytometry),通过特殊的金属标签抗体,它可以实现在单个细胞上几十个蛋白的同时检测。




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