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荧光定量PCR实验步骤

2021.10.30

  1、总RNA抽提(枪头和离心管均经过湿热灭菌,无RNA酶)

  1)取匀浆器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上预冷。

  2)取100mg组织,加入到匀浆器中。

  3)充分研磨直至无可见组织块。

  4)12000rpm离心10min取上清。

  5)加入250 μl三氯甲烷,颠倒离心管15s,充分混匀,静置3min。

  6)4℃ 下12000rpm离心10min。

  7)将上清转移到一新的离心管中,加入0.8倍体积的异丙醇,颠倒混匀。

  8)-20℃ 放置15min。

  9)4℃下12000rpm离心10min,管底的白色沉淀即为RNA。

  10)吸除液体,加入75%乙醇1.5ml洗涤沉淀。

  11)4℃下12000rpm离心5min。

  12)将液体吸除干净,将离心管置于超净台上吹3min。

  13)加入15μl无RNA酶的水溶解RNA。

  14)55℃ 孵育5min。

  15)使用UV1800检测RNA浓度及纯度:仪器空白调零后取2.5μl 待测RNA溶液于检测基座上,放下样品臂,使用电脑上的软件开始吸光值检测。

  16)将浓度过高的RNA进行适当比例的稀释,使其终浓度为200ng/μl.左右。

  2、反转录(枪头和PCR均经过湿热灭菌,无RNA酶)

  1)取一PCR管,加入含2μg RNA的溶液。

  2)加入1μl 逆转录引物。

  3)用无核糖核酸酶的去离子水补足至12μl。

  4)于PCR仪上65℃ 保温5min,迅速置冰上冷却。

  5)依次加入4μl 5×buffer,2μl 10mM dNTPs,1μl RNA inhibitor和1μl 反转录酶,用枪抽吸混匀。

  6)于PCR仪上42℃保温60min,结束后80℃保温5min灭活反转录酶。

  3、定量PCR

  1)取0.2ml PCR管,配制如下反应体系,每个反转录产物配制3管。

  2× qPCR Mix12.5μl

  7.5μM基因引物2.0μl

  反转录产物2.5μl

  ddH2O8.0μl

  2)PCR扩增

  预变性95℃,10min

  循环(40次) 95℃,15s→60℃,60s

  熔解曲线75℃→95℃,每20s升温1℃

  4、结果处理

  ΔΔCT法:

  A=CT(目的基因,待测样本) -CT(内标基因,待测样本)

  B=CT(目的基因,对照样本) -CT(内标基因,对照样本)

  K=A-B

  表达倍数=2-K

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