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全套病毒RNA m6A甲基化修饰研究工具的使用(二)

2021.3.01

       那么,病毒RNA修饰的研究工作流程有哪些呢?

 

       首先,提取病毒RNA

 

       无论您是从细胞,组织还是病毒等样品开始实验,高效而快速的RNA提取通常都是成功进行实验的第一步。工作流程的这一部分至关重要,因为足够的纯度和产量都是确保下游应用程序平稳准确运行的基本要求。

 

       而同时,在选择试剂盒的时候,要注意的是, 我们需要根据样本类型来挑选:

 

       1)病毒样本:对于病毒样品,诸如低病毒滴度和高污染宿主核酸的存在等挑战要求使用补充技术来确保产量和纯度符合下游实验的要求。在我们最近的公告文章中,我们概述了完成此操作的10种方法,因此您可以将其应用到最适合您的学习的方法中。实现病毒扩增的常用方法是:接种病毒至宿主细胞,扩大培养宿主细胞进行病毒扩增,然后收集扩增的病毒体,搭配EpiGentek的病毒RNA提取试剂盒提取病毒RNA。注意:对于直接从临床标本中提取的病毒RNA,在m6A RNA富集之前,需要去除宿主DNA和rRNA污染物。

 

       2)细胞/组织样本:不需要特别处理;由于可以从细胞和组织样品中获取大量丰富的RNA,因此不需要太多额外的处理就可以获得足够下游应用的RNA样本。我们建议使用EpiGentek总RNA快速提取试剂盒或EpiQuik 磁珠法快速RNA提取试剂盒。

 

      病毒RNA提取试剂盒
 

 

      总RNA提取试剂盒
 


       细胞核提取试剂盒

 

       当处理细胞或组织样本时,核提取的阶段很重要。而核提取物将最终进行甲基酶或脱甲基酶活性/抑制作用的分析。 在这一步骤中,EpiQuik 核提取试剂盒可以用预裂解和裂解缓冲液处理细胞/组织,分别破坏细胞膜和核膜,并提取核蛋白以用于下游实验。 我们的专有试剂盒含有所有核提取的试剂,可1小时的快速提取核蛋白,并可以保持完整的酶活性。

 

       当处理细胞或组织样本时,核提取的阶段很重要。而核提取物将最
终进行甲基酶或脱甲基酶活性/抑制作用的分析。在这一步骤中,
EpiQuik核提取试剂盒可以用预裂解和裂解缓冲液处理细胞/组织,分别
破坏细胞膜和核膜,并提取核蛋白以用于下游实验。 我们的专有试剂盒
含有所有核提取的试剂,可1小时的快速提取核蛋白,并可以保持完整
的酶活性。

 
       第二步,定量m6A/5mC RNA是必不可少的: 

 

       RNA甲基化是一种可逆的翻译后修饰,它在表观遗传上影响许多生物学过程,这些过程可能同时发生在病毒和非病毒来源的RNA中。其中最常见的是m6A甲基化,占所有RNA甲基化的80%以上,其次是5-mC甲基化,这可能发生在各种RNA分子中。如果您打算研究RNA中m6A或5-mC的总体甲基化水平,下表中的比色和荧光法试剂盒将会帮您快速,准确的定量。但是如果您的起始样本是病毒,那么可能您还需要先富集和纯化病毒以提高病毒RNA的产量,以适应下游实验。因为通常情况下,因为从病毒原料中收集到的少量RNA太少而无法在下游使用。我们建议参考我们最近的文章关于关各种病毒纯化方法以获取足够的病毒RNA量。

 

       RNA甲基化是一种可逆的翻译后修饰,它在表观遗传上影响许
多生物学过程,这些过程可能同时发生在病毒和非病毒来源的RNA
中。其中最常见的是m6A甲基化,占所有RNA甲基化的80%以上,
其次是5-mC甲基化,这可能发生在各种RNA分子中。如果您打算
研究RNA中m6A或5-mC的总体甲基化水平,下表中的比色和荧光
法试剂盒将会帮您快速,准确的定量。但是如果您的起始样本是病
毒,那么可能您还需要先富集和纯化病毒以提高病毒RNA的产量,
以适应下游实验。因为通常情况下,因为从病毒原料中收集到的少
量RNA太少而无法在下游使用。我们建议参考我们最近的文章关于
关各种病毒纯化方法以获取足够的病毒RNA量。


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