核酸的染色介绍
核酸染色法一般可将凝胶先用三氯乙酸、甲酸—乙酸混合液、氯化高汞、乙酸、乙酸镧等固定，或者将有关染料与上述溶液配在一起，同时固定与染色。有的染色液同时染DNA及RNA，如stains-all、溴乙锭、掊花青-铬矾法等，也有RNA、DNA各自特殊的染色法。
1．RNA染色法
(1)荧光染料溴乙锭(ethidium
bromide简称EB)：可用于观察琼脂糖电泳中的RNA、DNA带。EB能插入核酸分子中碱基对之间，导致EB与核酸结合。超螺旋DNA与EB结合能力小于双链开环DNA，而双链开环DNA与EB结合能力又小于线性DNA，可在紫外分析灯(253nm)下观察荧光。如将已染色的凝胶浸泡在1mmol/L
MgSO4溶液中1h，可能降低未结合的EB引起的背景荧光，对检测极少量的DNA有利。EB染料具有下列优点：操作简单，凝胶可用1-0.5μg/ml的EB染色，染色时间取决于凝胶浓度，低于1%琼脂糖的凝胶、染15min即可。多余的EB不干扰在紫外灯下检测荧光；染色后不会使核酸断裂，而其他染料做不到这点，因此可将染料直接加到核酸样品下，以便随时用紫外灯追踪检查；灵敏度高，对1ng
RNA、DNA均可显色。EB染料是一种强烈的诱变剂，操作时应注意防护，应戴上聚乙烯手套。
(2)焦宁Y(pyronine
Y)：此染色料对RNA染色效果好，灵敏度高。TMV-RNA在2.5%PAAG，直径为0.5cm的凝胶柱中检出的灵敏度为0.5μg；若选择更合适的PAAG浓度，检出灵敏度可提高到0.01μg；脱色后凝胶本底颜色浅而RNA色带稳定，抗光且不易退色。
2．DNA染色法
除了用EB染色外，还有以下几种方法：
(1)甲基绿(methyl grenn)：一般将0.25%甲基绿溶于0.2mol/L pH4.1的乙酸缓冲液中，用氯仿抽提至无紫色，将含DNA的凝胶浸入，室温下染色1h即可显色，此法适用于检测天然DNA。
(2)二苯胺(diphenylamine):DNA中的α—脱氧核糖在酸性环境中与二苯胺试剂染色1h，再在沸水浴中加热10min即可显示蓝色区带。此法可区别DNA和RNA。
