鉴于Alkbh5作为m6A
RNA脱甲基酶的显著生物学作用,阐明Alkbh5脱甲基活性的分子机制,引起了相当大的科学兴趣。为此,在这项研究中,研究人员报道了Alkbh5催化
核心的5个高分辨率晶体结构。他们发现,相比较其他AlkB蛋白,Alkbh5在这个家族典型的保守双链β螺旋顶部,显示出几个独特的结构特性。

  在这些独特的特征当中,Alkbh5一个截然不同的盖区,在底物识别和催化过程中起着重要的作用。在Cys230和Cys267之间结合的一个意想
不到的二硫键,通过给中央β折叠带来一个翻转域,是Alkbh5与单链RNA/DNA选择性结合的关键。研究人员根据几个结构引导的定点突变的脱甲基活性
检测,制备了一个Alkbh5底物结合模型。使用各种α-酮戊二酸(α-KG)类似物进行了晶体学和生化研究,结果表明,Alkbh5的活性部位腔比
FTO的小得多,并优先结合小分子抑制剂。

  总而言之,这些研究结果为理解Alkbh5的底物识别特异性,提供了结构基础,并为抗AlkB家族成员的选择性药物设计提供了依据。