膜蛋白质在外界物质识
别、运输以及信号传到等方面具有重要作用。据估计，药物靶点中，大约有2/3为膜蛋白质。基于离子液体的膜蛋白质样品预处理技术所选用的离子液体是1-丁
基-3-甲基咪唑四氟硼酸盐（BMIM BF4），这是一种常用的离子液体，极性和甲醇相近（甲醇：77；BMIM
BF4：67），结构和表面活性剂相近（亲水+疏水基团），易于去除（C18捕集性）。现有膜蛋白质处理技术中 BMIM
BF4方法可以鉴定到更多的跨膜蛋白质，与Urea及Rapigest方法比，可以分别提高80%与25%，与SDS和Methanol方法比，可以提高
3倍以上。鉴定的跨膜蛋白质比较：BMIM
BF4方法鉴定所得跨膜蛋白质分别包含SDS、Methanol、Urea和Rapigest方法所鉴定跨膜蛋白质85%、74%、74%、71%。