6月3日，这两条消息传到正在英国召开的应用生物信息和公共健康微生物学会议上，与会科学家立即开始分析华大基因研究院提供的病菌基因组序列。西班牙一家生物信息公司很快对新大肠杆菌的基因组序列进行自动分析，该公司研究员玛丽娜·曼瑞奎在自己的博客中写道：“在不到24小时的时间里，我们获得了数据、装配序列，并对序列进行解读。这是一个很好的研究范例。”

　　《科学》的文章指出，分析中呈现出的画面令人震惊。德国新病菌的DNA序列显示这个细菌不是典型的大肠杆菌菌属。新病菌与大肠杆菌55989的基因组同源性超过93%的，大肠杆菌55989是2002年从中非共和国一位罹患慢性腹泻、艾滋病病毒检测呈阳性的患者体内分离出来的。德国国家大肠杆菌参考实验室主任洛萨·伯坦说，出血性大肠杆菌属是肠集聚型大肠埃希菌菌属的一类，这种大肠埃希菌能在生物体内形成生物薄膜，更适应于出血性大肠杆菌在人体肠道内的聚集;然而，出血性大肠杆菌通常不会携带志贺毒素的基因，“这种新病菌看起来像是获得了志贺毒素基因的一种典型出血性大肠杆菌”。