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关于肽指纹图谱测定的相关介绍

2022.3.23

  质谱技术作为蛋白质组研究的三大支撑技术之一,除了用于多肽,蛋白质的分子量测定外,还广泛的应用与肽指纹图谱测定及氨基酸序列测定。

  肽指纹图谱(Peptide Mass Fingerprinting PMF)测定是对蛋白酶解或降解后所得多肽混合物进行质谱分析的方法。质谱分析所得肽断与多肽蛋白数据库中蛋白质的理论肽断进行比较,判断出所测蛋白是已知还是未知。由于不同的蛋白质具有不同的氨基酸序列,不同蛋白质所得肽断具有指纹特征。采用肽指纹谱的方法已对酵母、大肠杆菌、人心肌等多种蛋白质组进行了研究。对肽序列的测定往往要应用串联质谱技术,采用不同的技术选择特定质核比的离子,并对其进行碰撞诱导解离,通过分析肽断的断裂情况推导出肽序列。

  目前生物质谱被认为是大规模、高通量进行蛋白结构鉴定的首选工具。由于通过LC-MS/MS可直接鉴定蛋白混合物,因此将来有望不通过2-D就能研究蛋白质组。生物质谱的优势在于它能帮助我们研究蛋白-蛋白间相互作用、翻译后修饰乃至基因表达水平的变化等,具有极大的应用前景。

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