Southern杂交的结果分析
在膜上阳性反应呈带状。实验中应注意以下问题：转膜必需充分，要保证DNA已转到膜上。杂交条件及漂洗是保证阳性结果和背景反差对比好的关键。洗膜不充分会导致背景太深，洗膜过度又可能导致假阴性。若用到有毒物质，必需注意环保及安全。
（1）出现斑点
解决方法：①加热至合适的温度；离心或过滤除去颗粒。②不要把探针直接加到膜上。③戴无粉末的手套。④用均匀的溶液和底物覆盖膜。
（2）高背景
解决方法：①降低探针的浓度。②延长封闭时间。③提高洗膜温度，增加表面活性剂，降低盐浓度。④用高质量的滤纸接触膜。
（3）无信号
解决方法：①延长曝光时间。②通过EB染色确定转膜效果。③点试验检测探针活性。④增加探针浓度。⑤增加目标基因浓度。⑥转膜前充分变性。⑦固定之前，将膜浸入1×TE或水中。⑧洗膜时，增加盐浓度，降低表面活性剂浓度或温度。
（4）非特异带
解决方法：①降低探针浓度。②降低SSC浓度。③检查温度。④减少目标基因浓度。⑤用1×TE或0.1% SDS充分洗膜。
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