分子对接技术流程介绍
蛋白与小分子的对接
受体结构准备：通过数据库下载或同源建模构建受体三维结构；
药物分子准备；
对接口袋的确定蛋白与蛋白的对接
蛋白结构模型准备：通过数据库下载或同源建模构建受体三维结构；
对接，一般生成数万种pose
如果知道某些残基参与结合，那么可以对对接pose进行过滤
对对接POSE进行重新打分并排序，挑选2000种pose，计算all-against-all RMSD矩阵
根据RMSD进行聚类分析
根据聚类结果挑选模型进行能量优化，消除原子间的碰撞
蛋白复合物的相互作用分析，并作图
形成报告交付给客户
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