创新性方法或能帮助研究干细胞微环境
近日，一项刊登在国际杂志Nature Cell Biology上的研究报告中，来自欧洲分子生物学实验室等机构的科学家们通过研究开发出了一种新方法，其能够在单细胞水平下揭示骨髓的三维组织架构，由于骨髓中含有负责机体终生血液产生的造血干细胞，相关研究结果或有望帮助研究人员深入研究多种血液癌症发生的分子机制。
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研究者表示，这种新方法能帮助我们对复杂器官的特性进行分析，研究人员重点对小鼠的骨髓进行研究，其骨髓中含有产生毕生血液的造血干细胞，由于会影响干细胞和维持血液产生的能力，如今科学家们非常有兴趣利用骨髓环境来作为靶向治疗白血病的新型靶点。研究者Chiara Baccin说道，截至目前为止，我们并不清楚不同类型的细胞是如何在骨髓中进行空间组织，以及其又是如何彼此相互作用的，我们所开发的新方法就能够帮助揭示细胞的组成，即三维组织架构，以及细胞之间是如何进行相互作用的，文章中，研究人员鉴别出了此前未知的细胞类型—生境细胞（niche cells），其或许对于造血干细胞的调节非常重要。
为了理解骨髓中哪些细胞会影响干细胞的功能，研究人员将单细胞和空间转录组学技术与新型计算机技术相结合，通过分析单一骨髓细胞中的RNA内容物，研究人员鉴别出了32种不同的细胞类型，包括非常罕见和此前未知的细胞类型；研究者认为，这些罕见的生境细胞能在骨髓中建立一种特殊的环境，这对于干细胞的功能和新型血液和免疫细胞的产生都非常重要。
利用新型的计算机方法，研究人员并不仅仅能够在3-D模式下确定骨髓中不同细胞类型的组织架构，还能够预测不同细胞之间所发生的相互作用，本文研究提供了首个证据表明，组织中的空间相互作用或能根据基因组数据为基础进行计算推导；研究者Lars Steinmetz表示，我们的数据库对于世界上任何实验室都是开放的，这或许有助于完善体内的研究；我们所开发的新方法能在多种组织中使用，用来确定组织中细胞的3-D架构；如今这种方法也能被用来研究人类疾病的复杂病理学机制，目前研究人员还能利用该方法来研究诸如白血病等血液疾病。（
