关于外显子的表达序列介绍
在反式剪接中,不同mRNA的外显子可以被接合在一起。外显子在剪接（Splicing）后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。术语外显子也指编码相应RNA外显子的DNA中的区域。简言之,外显子就是指真核细胞的基因在表达过程中能编码蛋白质的核苷酸序列。关键概念：比较不同物种的相关基因,发现相应的外显子序列通常是保守的,而内含子序列则很少保守。编码蛋白质的序列通常处于选择压力之下,内含子由于没有选择压力,因此比外显子的进化快得多。通过确定在多种生物中出现的片段来鉴定编码区域,而外显子的保守性可以作为这种鉴定的基础。
人类大部分基因组序列都是被垃圾DNA序列分隔成一段段,给定一个已知的目标蛋白质和基因组序列,在该基因组序列中找出一组子字符串（候选外显子）,使得其拼接（剪接）与目标蛋白质最匹配（即去掉垃圾DNA序列）。一个强力方法是寻找基因组序列与目标蛋白质序列间的所有局部相似性。若第一个取自基因组序列的子字符串展示了充分相似性于目标蛋白质,那么这个子字符串可被认为是一个推定的外显子。将推定外显子结构化为基因组序列中的赋权区间,它可用三个参数（l、r、w）来描述,l、r分别是推定的外显子的左边、右边的位置,w为其权重。权重w可反该区间是一个外显子的可能性。链是不重叠赋权区间的任一集合,一个链的总权重是该链中所有区间的权重之和。给定一个推定的外显子集,寻找非重叠的推定的外显子的一个最大集。输入：赋权区间（推定的外显子）集。输出：该集合中区间的最大。
推荐
