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新型冠状病毒核酸检测与PCR技术应用

2022.10.18

 首先需要采集患者的病毒样本,而由于采集的临床标本中病毒含量往往是非常少的,提取分离出的遗传物质更加少,需要扩增到可检测数量,才能做出诊断,即需要做PCR反应,它叫作聚合酶链式反应(PolymeraseChain Reaction),实际上就是一个基因的扩增反应。由于2019新型冠状病毒为RNA病毒,可以通过逆转录与荧光定量PCR(RT-PCR)技术相结合的方法,即将待测RNA样本进行逆转录得到cDNA,再根据病毒基因组序列中保守性且特异性靶核酸如编码N蛋白基因序列设计引物和探针,再以其为模板进行PCR扩增,同时通过荧光探针实时检测扩增产物,可以做到病毒的快速定量检测,来起到诊断和监测病原体的作用,基本步骤如下面框图所示。
    基本步骤

       聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊DNA复制,PCR的最大特点是能将微量的DNA大幅增加。因此,无论是化石中的古生物、历史人物的残骸,还是几十年前凶杀案中凶手所遗留的毛发、皮肤或血液,只要能分离出一丁点的DNA,就能用PCR加以放大,进行比对,这也是“微量证据”的威力之所在。由1983年美国Mullis首先提出设想,1985年由其发明了聚合酶链式反应,即简易DNA扩增法,意味着PCR技术的真正诞生,到如今,PCR已发展到第三代技术——数字PCR技术。1976年,中国科学家钱嘉韵,发现了稳定的Taq DNA聚合酶,为PCR技术发展也做出了基础性贡献。

    具体过程是利用DNA在体外摄氏95°高温时变性会变成单链,低温(一般是60°C左右)时引物与单链按碱基互补配对的原则结合,再调温度至DNA聚合酶最适反应温度(72°C左右),DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链。基于聚合酶制造的PCR仪实际就是一个温控设备,能在变性温度,复性温度,延伸温度之间很好地进行控制。经30个左右的温度循环,可使目的片段得到指数级的扩增。那么,反推可知,能检测到大量DNA目的片段的即是阳性样品。

    PCR的基本原理可以用下面的示意图进行表示,左边部分是反应体系的成分组成,右边是一个循环的反应过程。
    PCR的基本原理


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