3个新肺癌生物标志物
在本期出版的《Carcinogenesis》中，研究小组报道了三个新的容易使人患病的单核苷酸多态性（SNPs），其中2个SNPs可提高非小细胞肺癌（non-small-cell lung cancer，NSCLC），另一个对应肺鳞癌风险。三个新SNPs为肺癌风险筛查和干预提供了潜在候选生物标志物。
“在全基因组相互作用筛查仍是个挑战的今天，大多数全基因组关联研究（GWAS）都为主要起效的相关基因而设计，很少有做互作分析的，”项目领导者Yafang Li博士说。“这项研究是迄今为止最大规模的肺癌全基因组SNP与吸烟行为的相互作用分析报告。我们在分析中采取了两步骤策略以减少普通基因与环境相互作用分析的功率损耗。”
“首先，我们进行了13336例NSCLC病例相互作用分析来评估SNPs与吸烟行为，p值小于0.001的候选SNPs被进一步与13970名对照比对，进行标准病例与对照相互作用分析。”
“利用包括5377个对照和3054个NSCLC病例的独立复制数据集，进一步验证p值小于3.5x10–5的明显SNPs。通过组织学亚型分层分析，我们最终确定了rs6441286和rs17723637是两个肺癌高风险SNPs。此外，吸烟和rs4751674的互动表明，后者是肺鳞癌的高风险SNPs。”
尽管，这一报道研究使用的数据仅限为高加索人群，但研究人员表示将使用其他人类种群基因型确定行为与基因型之间的相互作用。
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