酵母双杂交实验
实验概要
本实验构建了Bait载体和prey载体,酵母双杂交后,应用CPRG法定量测试了蛋白质相互作用。
实验步骤
1. Bait载体的构建
将高保真PCR扩增的OsCCTlb(引物为OsCCT1bEcoRI5'和OsCCTlbXhoI3')和OsCNTlb(引物为OsCNTlb EcoRI5'和OsCNTlbXhoI3')基因片段用EcoRIlXhoI双酶切后连接入pLexA的EcoRI/XhoI位点。DNA测序正确后用于实验。
2. prey载体的构建
用高保真聚合酶扩增OsCRYlb(引物为OsCRYlbEcoRI5'和OsCCTlbXholI3')和OsCOPl缺失第1-162个氨基酸的片段OsCOPl⊿l-162(引物为OsCOP1487EcoRI5'和OsCOP1XhoI3')。PCR产物用EcoRIlXhoI双酶切后分别连接入pB42AD的EcoRI/XhoI和EcoRI/XhoI(平端)位点。DNA测序正确后使用。
3. 酵母双杂交
1) 摇菌(准备转化用)
45mLYPD加5mL 20%葡萄糖(Glucose)。加入100uL EGY48酵母菌,摇一天。
2) 转化(一步法)
a. 取酵母菌液1.5mL于Eppendorf管中,12,000rpm离心1 min。
b. 用枪吸尽上清液,加入one-step buffer 100微升。
c. 吹打匀后加入到混合液(carrier DNA 6uL,pSHI18-34 5uL,bait 3uL,prey2.5uL)中,震荡混匀,45℃水浴30min。
d. 涂板(生长培养基加Glucose加AA-His-Trp-Ura ),30℃放置3天左右。
3) 挑克隆
每个样品挑10个于1mL液体生长培养基培养一天(30℃,220rpm )。
4) 诱导
从摇出的菌液分别取100ul放入2mL诱导培养基中培养13小时左右,OD值大约为0.8到0.9。
5) CPRG法定量测试蛋白质相互作用
a. 取诱导出的菌液1mL,13,000rpm离心1 min,弃上清。
b. 加入1 mL buffer 1,震荡混匀,离心1 min。
c. 弃上清,留下大约100uL,震荡混匀。
d. 液氮速冻1 min,放37℃水浴1 min,然后再放液氮1 min,放37℃水浴1 min。
e. 加入900uL buffer2(这里开始计时),震荡混匀,离心1 min,取出上清加入到比色杯中。
f. 计时到l0min分钟时加入0.5 mL 3 mM的ZnC12,吹打均匀。
g. 测其OD值(578nm)和菌液OD值(600nm)。
得出的数值套入公式:Units=1000xOD578/elapsed time (min) x Volume (mL) x OD600即可计算出两蛋白相互作用值。
注意事项
在本实验中,由于本底非常高,所以在进行CPRG法测试前将所有菌液稀释10倍后再做分析。