AMRESCO琼脂糖的使用方法指导
正确的加热方式对琼脂糖的充分溶解和凝结至关重要,在此,我们提供以下几点作为正确制备琼脂糖凝胶的操作参考。
*AMRESCO琼脂糖加热溶解所需时间短。
*琼脂糖在TAE或者TBE缓冲液中不溶解,加热时,琼脂糖颗粒水化形成溶液,水化是时间依赖的,不同的琼脂糖水化点不同。AMRESCO琼脂糖纯度高,超微颗粒,非常适合作为电泳实验载体。对比于其他的琼脂糖,AMRESCO琼脂糖水化速度快,使用者无需煮沸过长时间,否则易导致胶液浓稠,不利于混匀,凝胶后易破损。
AMRESCO琼脂糖凝胶制备
用1×TBE溶液配制1%浓度琼脂糖凝胶
用于制备胶液的锥形瓶体积应为胶液体积的2-4倍,缓慢向缓冲液中加入琼脂糖,边加边搅拌,防止琼脂糖聚集。记录瓶体和溶液总重量。
微波炉高火加热30s,根据配制的溶液体积调整加热时间。加热时间与微波炉、瓶体大小和琼脂糖浓度有关。
摇匀琼脂糖溶液。
再次高火加热30s,摇匀琼脂糖溶液。
将溶液再次放回微波炉,高火加热至沸腾(大约10-35s)。接触移动时琼脂糖胶液可能会剧烈沸腾,小心操作,避免烫伤。从微波炉拿出后,室温冷却1-2min,轻轻摇晃使液体里的气泡溢出。
重新放回微波炉,高火加热,使之沸腾约15s,观察琼脂糖的溶解状态,如果仍有颗粒存在,重复该步骤直至所有晶体全部溶解。
待琼脂糖完全溶解成液体,重新称量总重量,计算蒸发液体量,用水补齐至原始重量,摇匀液体。
建议胶液冷却至50-55℃时灌胶,有利于凝胶孔径均匀一致,不至于损伤制胶仪。灌胶前轻轻摇晃琼脂糖溶液,释放胶液中残存的气泡。
向制胶槽中灌胶,一般胶的厚度3-5mm,灌胶后尽量排除梳孔之间或底部的气泡。
在室温放置(30-45min)使胶充分凝结。
如果要制备不同浓度和不同体积的凝胶,请注意以下两点:
在凝胶溶液煮沸前至少进行2次摇匀。
胶液沸腾后,每隔10-15s观察一次胶液溶解程度(间隔时间取决于胶液浓度和体积)。
Guidelines for small fragment resolution using AMRESCO Agaroses
0815 | Agarose 3:1 ™ E776 | J234 | 备注 | |
<0.5kb 分析 ~2% | 不建议 | 4-5% TBE Buffer | 3.5-5% TAE or TBE Buffer | Agarose SFR适合,Agarose 3:1透明度较差 |
<0.5kb 分析 ~3-5% | 3-4% TBE Buffer | 3% TBE Buffer | 3-4% TAE or TBE Buffer | Agarose SFR和Agarose 3:1在指定浓度下机械强度较Agarose Ⅱ高,不易碎。 |
<0.5kb 制备
| 2-4% TAE or TBE Buffer | 不建议 | 2-5% TAE or TBE Buffer | 浓度根据分辨率来选择。低浓度能提高片段回收纯度,TBE缓冲液不适合一些商品化的回收试剂盒。 |
0.5-2.0kb 分析 | 1.5-2.5% TBE Buffer | 1.5-2.5% TBE Buffer | 1.5-2.5% TBE Buffer | Agarose SFR电泳时间长,易导致片段弥散
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0.5-2.0kb 制备 | 1.5-2.5% TAE or TBE Buffer | 不建议 | 1.5-2.5% TAE or TBE Buffer | Agarose Ⅱ适合,1kb以上更佳。TBE缓冲液不适合一些商品化的回收试剂盒。
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1.0-3.0kb 分析 | 1-1.5%
| 1-1.5%
| 1%
| Agarose 3:1适合Agarose Ⅱ凝胶强度不适合印记实验。 Agarose SFR电泳时间长,易导致小片段弥散 |
以上数据仅供参考,具体选择依据实际试验要求。
参考电压5V/cm,低熔点琼脂糖电泳超过1小时者,选择较低电压3-4V/cm或者在4℃条件下电泳。