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NCBI的使用指南之Map viewer

2020.3.09

Map viewer是NCBI 网站上提供的一个非常有用的寻找基因的工具,通过Map viewer你可以了解你感兴趣基因在基因组中所处的位置、基因序列、内含子及外显子的排列、基因的细胞遗传学图、EST.SNP等等许多有用的信息。进入Map viewer的方法如下:点击NCBI首页的Map viewer


 

NCBI的使用指南之Map viewer

 

进入Map viewer的首页,在Search下拉框内选择你寻找基因的生物种 类【eg:Homo sapiens(human)】在后面输入你基因的名称(eg:hcn4)或者是关键词【hypertension】单击go 。如果下图显示不清,可单击图形放大观看。

 


NCBI的使用指南之Map viewer

 

出现下图,图中用红色断棒给出标记的地方即为hcn4基因所处的位置,在找到hcn4基因的染色体 下给出一红色数字1。图形显示不清可单击图形放大。


 

NCBI的使用指南之Map viewer

 

出现下图,图中用红色断棒给出标记的地方即为hcn4基因所处的位置,在找到hcn4基因的染色体 下给出一红色数字1。图形显示不清可单击图形放大。


 

NCBI的使用指南之Map viewer

 

单击标记染色体 下面的蓝色数字出现下图,图中给出hcn4基因及其周边基因的信息,hcn4自动标记。我用棕黄色框标记部分为绿色框中一系列缩写的解释,你可以通过点击缩写(sv、dl等)执行相应的功能。


 

NCBI的使用指南之Map viewer

 

点击dl出现下图,单击Save to disk可将你要的基因的序列存盘。Map viewer的功能比较强大,看完以上的介绍后如果你觉得对你的工作有帮助的话,可参看Map viewer的帮助文件。


NCBI的使用指南之Map viewer

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