基于108种樟目植物基因组及序列构建九分支系统进化树
樟科（Lauraceae）是被子植物木兰亚纲（Magnoliidae）的重要类群，约有60属3500种，占木兰类植物种类的三分之一。当前，樟科分类系统问题尚未解决，先前基于部分形态学特征建立的无根藤亚科和樟亚科，以及樟亚科中的厚壳桂族、鳄梨族和月桂族备受争议。
为了确定樟科植物的族（tribe）界定、厘清族之间的关系，版纳植物园生物多样性研究组研究人员及其合作者利用131种植物的质体基因组和序列，成功构建了樟科六族九分支的系统结构，进一步形态学特征的统计检验也支持上述系统关系。基于高支持的质体基因组系统发育树，樟目和樟科的单系属性再次得到确认。樟目内部由莲叶桐科（Hernandiaceae）和玉盘桂科（Monimiaceae）共同组成樟科的姐妹群，香皮檫科（Atherospermataceae）和奎乐果科（Gomortegaceae）互为姐妹群组成第三分支，蜡梅科（Calycanthaceae）形成位于基部的第四分支。坛罐花科（Siparunaceae）的系统位置因数据缺乏未能得到解决。樟科内部六族包括：棠桂族（Hypodaphnideae），厚壳桂族（Cryptocaryeae），无根藤族（Cassytheae），新樟族（Neocinnamomeae），檬果樟族（Caryodaphnopsideae）和樟族（Cinnamomeae）。其中，新樟族和檬果樟族为两新族在本研究中正式发表，而樟族包含的种类大幅增加。樟族又可再分为绿新樟-桂土楠属分支（Chlorocardium-Mezilaurus clade），润楠-鳄梨属分支（Machilus-Persea clade），樟-甜樟属分支（Cinnamomum-Ocotea clade），以及月桂-新木姜子属分支（Laurus-Neolitsea clade）。进一步基于形态学特征的系统发育信号检测表明，上述系统发育关系与两性花的分化、生活型、花序类型、子房位置、药室数目、叶序、叶脉序、叶脉数和花序着生位置等都相吻合。至此，分子系统学的结果和形态分类性状通过统计检验相互印证，樟科分类系统的骨架也已搭建完成，为后续各个属群深入地系统分类工作奠定了基础。
该研究成果以Plastid phylogenomics improve phylogenetic resolution in the Lauraceae 为题，在线发表于国际学术期刊Journal of Systematics and Evolution上。
基于108种樟目植物质体基因组及序列构建的樟科九分支系统进化树
