成功进行凝胶迁移实验需要优化哪些因素？
凝胶迁移实验在理论上很简单也很快速，但要成功地进行凝胶迁移实验，需要优化一些参数，这主要受结合蛋白的来源和探针结合位点特点的影响。以下是需要优化的因素：抽提液的制备（核酸酶和磷酸酶污染会使探针降解），结合蛋白的浓度，探针的浓度，非特异性探针的浓度，缓冲液的配方和pH，聚丙烯凝胶电泳的特点和电泳条件，保温时间和温度，载体蛋白，是否有辅助因子（比如锌，或镉等金属离子，或激素）。
总之，反应总体积应最小（20μl）。为满足一般要求，结合缓冲液含4%甘油，1mM
MgCl2，0.5mM EDTA，0.5mM DTT，50mM NaCl，10mM Tris-HCl（pH7.5）， 0.05mg/ml
poly dI:dC，或10mM HEPES（pH7.9）， 50mM KCl，1mM DTT， 1mM
EDTA，10%甘油，0.05mg/ml poly dI:dC可作为优化实验的起始。
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