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精准医学高端对话 | ProCan®国际癌症蛋白质组中心专家来华访问
在精准医学时代，SCIEX 推出了基于SWATH-MS技术的“工业化”规模的组学研究流程。而且从疾病研究、精准诊断、精准治疗和健康管理四个维度，对精准医学的宏观策略方向的解读。SCIEX的美好愿景是“让质谱改变每个人的生活”，我们更期待“让质谱更精准地为健康服务”。
ProCan®国际癌症蛋白质组中心
全球第一个 “SCIEX精准医学创新中心”。该中心由澳大利亚癌症研究基金会赞助，拥有6套SCIEX TripleTOF®6600高分辨质谱平台、NanoLC 400系统，以及OneOmicsTM云计算数据处理系统和Beckman自动化样品处理系统。ProCan中心也是全球“癌症登月计划（Cancer Moonshot）”合作单位。Phil Robinson教授是ProCan中心的创始人之一，近日访问上海血液学研究所和上海儿科医学研究所开展国际学术交流活动。ProCan中心癌症大数据科学组的主任Qing Zhong博士同行访问。
ProCan中心质谱平台概览
Phil Robinson 博士，澳大利亚悉尼大学医学院资深教授，澳大利亚纽卡索大学化学教授， 澳大利亚癌症研究基金会激酶蛋白组学中心(ACRF-CFK)主任。Phil Robinson教授是ProCan中心的创始人
Phil Robinson教授在上海血液学研究所和上海儿科医学研究所，做了题目为《精准医疗中的工业化蛋白组实践》学术报告。Phil Robinson教授提到，癌症的发生发展具有很高的异质性，与个体、病理状态、临床应答等息息相关，ProCan研究中心希望通过基于大队列样本的数据采集、挖掘和整合，来预测临床个体化的精准诊疗方案。ProCan已采用SCIEX TripleTOF® 6600高分辨质谱及SWATH数据采集方式，建立了高通量、工业级的癌症蛋白组分析流程，成熟应用于70,000多份临床活体组织样本分析。作为大数据分析的基石，Phil Robinson教授强调蛋白质谱数据采集的关键点，即：稳定、快速、可定量。相比于经典的数据依赖采集方式(DDA)，SWATH(DIA)对样本中所有一级和二级质谱信息进行全覆盖，将生物样本转化为数字样本便于保存和数据再挖掘；SWATH所提供的全面的高分辨二级质谱信息可以有效提升蛋白鉴定数量和准确性，同时，利用高分辨子离子进行定量，显著降低基质对目标多肽的干扰，提高定量灵敏度。为了保证跨分析平台数据的一致性，Phil Robinson总结ProCan的经验，对中心的6台TripleTOF®6600进行调教和设备间的验证，同一份临床样本也会在不同的6600上分析和比对，以确保数据的可靠性。
Qing Zhong博士，ProCan中心癌症大数据科学组的主任, 澳大利亚悉尼大学高级讲师
Qing Zhong博士拥有跨界背景，将计算机科学和生命科学交叉融合应用于癌症组学大数据分析。他关注如何让海量的组学数据转化为有有意义的临床信息和知识，并通过大数据的统计学分析、可视化和深度学习来推动精准诊疗方案的制定。Qing Zhong博士详细介绍了他与来自于全球的合作者们正在开展的3个癌症大数据研究项目：前列腺癌蛋白组、儿童成神经细胞肿瘤蛋白组、卵巢癌蛋白组。通过大数据分析，也能直观体现出在6台TripleTOF® 6600 系统上所获得SWATH质谱数据的重现性，来指导批次校正、FDR控制和缺失值归因。
上海血液学研究所与会者的合影
黄秋花研究员（上海血液学研究所）、严威研究员（上海交通大学系统生物医学研究院）、印彤研究员（上海血液学研究所）及其他十多位老师共同参与了学术交流。对于Phil Robinson教授和Qing Zhong博士介绍工业化蛋白组流程和癌症组学大数据研究表现出极大兴趣。
上海儿科医学研究所与会者的合影
在Phil Robinson 教授对上海市儿科医学研究所学术交流过程中，小儿内分泌遗传代谢病研究室张惠文主任感谢Phil Robinson教授和Qing Zhong博士来访，表示新的样品处理方法和组学研究方案对他们接下来的研究思路和实验设计提供了帮助，期待开展非常见儿科疾病的标志物探索性研究。儿研所的老师十分认真，提前准备了许多实验中遇到的蛋白和代谢分析相关问题，与ProCan及SCIEX专家深入探讨解决方案。
