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揭秘鹿明生物的中药代谢组学分析平台,为中药研究提供强有力支持!

鹿明生物
2023.7.12

中医药从整体观出发,致力于维持人体内外阴阳平衡以攻克疾病、保障健康。近年来,中医药在疾病早期干预、联合用药、肿瘤控制、复杂慢性病(心脑血管、糖尿病等)、大健康等领域疗效显著,展现出巨大优势,在世界范围内受认可度空前提高。但是,难以用现代化的药物-分子-机理机制的语言模式清楚阐释其作用。同时,中医药因具有多组分、多靶点、多途径的特点,更使得解析其药理药效作用机制变得十分复杂,这也正是中医药现代化研究难以取得进一步突破的关键原因。因此,建立基于现代先进科学技术手段的中医药研究已成为现代中医学研究的主要方向。

鹿明生物深耕质谱组学服务多年,凭借在组学方面的技术优势,建立了1)基于液质联用技术的中药代谢组学分析平台;2)基于DESI体系的中药  空间代谢组学分析平台;3)基于中药标准品的高精准数据库及中药代谢产物数据库LuMet-TCM,可为广大研究者提供1)中药单体/复方成分分析;2)  中药入血/入靶原型成分及其代谢产物、代谢途径分析;3)网药/系统药理学;4)中药非把代谢组;5)中药空间代谢组;6)多组分药代动力学等多项特色 技术服务,为中药质量评估、中药活性成分筛选、药物靶点发现、药物作用机制等研究提供大力支持。

中药成分鉴定

技术介绍:通过UPLC-HRMS液质联用平台结合LuMet-TCM1.0数据库对不同 剂型的中药材复方/单体的有效成分进行定性定量分析,明确中药发挥药效作用的物质基础。

产品优势:

·数据库库容大:5000+中药活性成分、全标准品打造

·数据库质量高:20000+二级谱图,含RT、MS1、MS2三维度精准定性 

·Thermo-Obritrap-QE 高分辨质谱:定性定量稳定性好,可重复性高

应用场景

1)药用资源保护、品种选育及抗逆研究

2)炮制对中药化学成分差异的影响

3)不同基源中药成分研究

4)不同提取溶剂的中药成分组成

5)中药不同部位成分及差异研究

6)中药复方、中成药、民间方成分研究

入血/入靶成分分析

技术介绍:通过UPLC-HRMS  液质联用平台结合LuMet-TCM2.0 数据库(2万+ 代谢产物数据库)对中药材复方/单体入血/入靶的有效成分(原方 成分及其代谢产物)进行定性定量分析,明确中药在体内发挥药效 作用的物质基础及代谢途径。

1

产品优势

· 自研数据库库容大,定性准:25000+中药活性成分及其代谢产物;10万+二级谱图,含RT、MS1、MS2三维度精准定性;提供中药代谢   产物和代谢途径的分析

·高通量:可同时搜不同数据库, 一针分析中药入血原型成分、中药 代谢产物和内源性代谢物

2

应用场景

1)有效物质筛选和鉴定;

2)作用机制研究生物利用度研究:

3)药物相互作用研究

4)个体化用药研

5)抗逆研究:抗旱、抗虫、抗酸、抗碱、抗盐、抗高低温等类型的研究。

3

数据分析结果

系统/网络药理学分析

技术介绍:通过 UPLC-HRMS液质联用平台结合LuMet-TCM2.0数据库获得中药 复方/单体有效成分,结合网药+分子对接挖掘中药成分治疗疾病的潜 在作用靶点,并结合其他组学数据或实验验证数据,揭示并验证中药  复方/单体的药效基础和作用机制。

产品优势:

·系统性高:基于真实数据不断建立完善相关数据库,丰富靶点和通路 研究周期短,效率高:专业的研究团队, 一站式服务平台

·通量大:基于强大的数据库,可同时分析研究多个通路和靶点

应用场景

1)中药活性组分筛选;

2)系统通路、靶标发现;

3)中药中药药理学、药效学验证及整体作用机制阐释;

4)中医基础理论研究如药物组合、复方配伍规律、性味归经、病证关联; 

5)中药临床合理用药、新药研发

数据分析结果

中药非靶代谢

技术介绍:本研究通过UPLC-HRMS液质联用平台结合LuMet-TCM 数据库分 析,实现高通量对中药中代谢物的定性定量,结合多元统计分析筛 选差异代谢物。

1

产品优势

·数据库全面、库容大

·定性精准且提供相对定量

·数据质量好,通量大

·高分辨高精密度仪器平台

2

应用场景

1)中药炮制方法差异研究

2)不同品种成分差异机制研究

3)不同环境中药植物成分差异机制研究

4)中药植物次生代谢物合成通路构建

5)不同组织部位次生代谢物积累机制研究等

3

数据分析

中药空间代谢组学

技术介绍:利用(AFAI-MSI)技术的高检测灵敏活性,免标记对中药组织样本进行 离子采集和成像分析。实现对中药成分的非靶定性和功能代谢物的生 物合成及特征空间分布等的精准描述。

产品优势:

高准确性:△m/z=0.001。自建标准品数据库+自研空代定性算法

高覆盖度:全面覆盖各类型中药组织

高特异性:实现组织结构和功能代谢物的识别与特征分布

应用场景

1)特定代谢物时空分布的可视化;中药成分的组织分布及代谢物

2)生物合成途径阐释

3)疾病诊断和生物标记物发现;

4)植物-环境相互作用;

5)确定名贵中药材成分分布,助力组织培养技术。

数据分析结果

多组学药代动力学

技术介绍:通过LC-HRMS 技术同时监测中药复方原型成分及其代谢产物在体内 的变化过程,从而阐明主要活性成分在体内的药代特征,结合药效学 可获得药物暴露量与药理效能之间的关系,进而指导中药新药的研  发及临床安全性及有效性评估等。

1

产品优势

·定量限低、绝对定量分析准:

·专属性强

·数据质量高

2

应用场景

1)临床药理学/毒理学

2)药物相互作用

3)药物研发

4)中药标准化和质量控制

3

数据分析

数据库介绍

1.中药标品+代谢产物数据库 (LuMet-TCM):

1.中药标品+代谢产物数据库 (LuMet-TCM):  总库容为25000+,其中包括5000余种中药标准品及20000余种中药代谢产物。涵盖中国药典及其他重要中药材500余种,全面覆盖十余类中药成分,主要包括糖苷类、苯丙素类、黄酮类、萜类、甾体类、生物碱、酚类、鞣质等,中药有效成分涵盖抗氧化、抗衰老、抗炎、抗病毒、抗肿瘤、抗癌、改善心血管功能、免疫调节等多种药理活性。可满足当前不同研究方向的中医药科学家研究需求。结合 LuMet-animal   数据库,可以实现一针进样可同时分析入血/靶成分和机体内源性代谢组变化。

2.动物源代谢物质谱数据库(LuMet-animal)

2.动物源代谢物质谱数据库(LuMet-animal): 总库容量为10000+,其中 包括2000+标准品以及8000+基于标准品构建预测模型扩建的本地数据 库。本数据库信息完善,含有保留时间、 一级精确质量信息、二级质谱碎片信 息、代谢物分类信息、分子量、分子式、CAS 号、KEGG 号、InChIKey。 搜库采用一级质谱匹配,同位素峰匹配,二级质谱匹配,保留时间匹配等多维度匹 配,大大提高了定性的准确性。数据库主要包括(氨基酸、有机酸、核苷、吲 哚、类固醇、胆汁酸)及其衍生物、碳水化合物、有机杂环类、酰基肉碱类、溶 血磷脂类、苯类及暴露组相关的等共计13大类代谢物,覆盖糖酵解/糖异 生、TCA 循环、苯丙氨酸、色氨酸代谢、类固醇生物合成、类固醇激素生物合 成、初级胆汁酸生物合成、甘油磷脂代谢等几十余条重要代谢通路。

3.中药空间代谢质谱数据库(LuMet-Space)

3.中药空间代谢质谱数据库(LuMet-Space): 包括针对人和动物数据库,目前含4000+物质,涵盖氨基酸、脂质、核苷酸、碳水化合物、维生素和辅助因子、激素等物质;针对植物,含有6000+物质,涵盖生物碱类、酚酸类、黄酮类、香豆素类、苯丙素类、木脂素、萜类等10大类代谢物;LuMet-TCM 中药标品及代谢产物数据库。

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鹿明生物质谱平台介绍

上海鹿明生物科技有限公司是欧易生物旗下从事蛋白质组及代谢组质谱检测的专业质谱组学服务公司。公司建有国内第一个空间代谢组商业服务平台,深耕质谱组学检测分析,具体包括空间代谢组、双平台代谢组、靶向代谢组、TMT标记定量蛋白组、翻译后修饰蛋白组、4D-DIA蛋白组、单细胞及超微量蛋白组、空间蛋白组等。创新质谱组学平台广泛应用于机制解析、分型诊断、标志物筛选、药靶发掘等多个领域。公司并先后获得高新技术企业、上海市专精特新企业并建有院士专家工作站,自有包括tims tof pro2在内的各类大型质谱近二十台套,年服务项目超2000项。鹿明生物协助合作伙伴发表SCI论文近千篇,成功打造以硬数据、好服务为基础,以空间代谢组为特色的质谱组学检测服务公司品牌。

END 

鲲 撰文

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本文系鹿明生物原创

转载请注明本文转自鹿明生物

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