而传统方法大多以双链cDNA为初始样本,难以确定测序所得序列来自转录本的正义链还是反义链而干扰后续数据分析。同时,SOLiD强大的测序能力,使得高通量发掘低拷贝转录本成为可能。 3. 基因组所SOLiD测序仪运行情况 目前,ABI公司针对我所SOLiD实验小组的技术培训基本结束。SOLiD实验小组已经具备独立构建基因组片段文库和末端配对文库的能力,所构建文库各项质量指标基本符合要求。...
而传统方法大多以双链cDNA为初始样本,难以确定测序所得序列来自转录本的正义链还是反义链而干扰后续数据分析。同时,SOLiD强大的测序能力,使得高通量发掘低拷贝转录本成为可能。3. 基因组所SOLiD测序仪运行情况目前,ABI公司针对我所SOLiD实验小组的技术培训基本结束。SOLiD实验小组已经具备独立构建基因组片段文库和末端配对文库的能力,所构建文库各项质量指标基本符合要求。...
本研究运用通过去除核糖体技术构建的转录组文库的二代测序数据,该项技术理论上可以捕获较全面的RNA分子。通过深入分析,在小鼠的大脑、睾丸和胚胎干细胞中发现了几千个新的转录本(大部分是非编码RNA)。这些新检测到的转录本与转录起始和延伸的信号密切相关,在这些转录本上游,科研人员看到了H3K4me3,RNAPII结合位点和CAGE等标志转录起始的特征。...
为验证转录组测序结果中嵌合事件来源由文库构建过程随机连接引入,本研究通过对SARS-CoV-2感染细胞和未感染斑马鱼胚胎的RNA进行混合,然后构建RNA测序文库并进一步进行转录组测序,结果表明:除了预期的人-病毒嵌合RNA片段,还检测到了自然条件下不可能存在的斑马鱼-病毒嵌合RNA片段,且不同物种的嵌合读段数与各自在混合样本中的RNA丰度比例相关,证明了这类嵌合读段来自文库构建过程中的随机连接。 ...
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