初步序列鉴定 德国国立溶血性尿毒综合症咨询实验室的科研人员应用经典的血清学分型方法和基于Sanger测序法的毛细管电泳测序技术(CE),对该疫情致病因子的特征进行研究,并使用Applied Biosystem 3130基因分析仪进行多位点序列分型(MLST)研究。基于多条基因的序列片段,MLST技术能够对分离菌进行鉴定。...
针对益生菌产品,该技术体系提取所有的细胞进行重水饲喂和单细胞拉曼光谱的高通量采集,取代了首先提取总核酸或者进行平板培养。随后,在每一张拉曼光谱上,利用其指纹区,基于与益生菌单细胞拉曼光谱参照数据库的比对,快速完成每个细胞的种类鉴定环节。通过构建21种法定可食用益生菌的标准菌株拉曼光谱数据库,该质检技术体系可实现平均高达93%的分辨准确度。...
通过PFGE分型可以对细菌性传染病、食源性致病菌进行监测,同时可以进行分子流行病学的调查,但是操作较为烦琐,需要较高的实验技能方可掌握。 全基因组测序技术可以对菌株进行最为有效的分型,即使是16S差异不大的菌株,也可以通过分布在整个基因组上的单核苷酸多态性位点进行区分,是目前分型能力最为强大的技术之一。但全基因组测序用于微生物鉴定工作的主要障碍在于使用成本高和专业的数据分析。 ...
Priebe解释说:“由于许多乳酸杆菌属都定植于胃肠道中,因此需要通过全基因组测序中进行高精度区分。其他的细菌指纹识别法(例如脉冲场凝胶电泳)不能提供足够高的区分度来确保两个菌株真正匹配。” 测序结果与在医院传染病诊断实验室获得的鉴定结果相符。 ...
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