鼻息肉的22DE图谱建立和蛋白质组学分析

上一篇 / 下一篇  2008-12-20 21:21:20/ 个人分类:蛋白质

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[摘要]  目的: 建立鼻息肉鼻黏膜双向凝胶电泳( two 2dimensionalpolyacrylamide gel electrophoresis,2 2DE) 图谱,鉴定差异表达蛋白质。方法: 收集鼻息肉及鼻黏膜样本各7 例,采用固相pH 梯度2 2DE,凝胶银染,扫描图像, ImageMaster 2 2DE软件比较分析等方法,识别差异表达蛋白质, 通过质谱分析得到相应肽质指纹图谱( pep tide mass fingerp rint, PMF ) ,采用Pep tIdent软件查询Swiss2Prot and TreMBL 数据库, 鉴定差异表达蛋白质。结果: 建立了鼻息肉和鼻黏膜蛋白质的2 2DE图谱。鼻息肉和鼻黏膜3 块凝胶的平均蛋白质点数分别为82 5 ±78 和9 36 ±6 2; 平均匹配点数为6 82 ±9 6 和8 21 ±7 8 , 匹配百分率为82. 7%和8 7. 7% ; 同一鼻息肉的3 块胶在蛋白质点位置上有较好的重复性, 不同胶间蛋白质点在等电聚焦( IEF )方向偏差为( 1. 0 6 ±0. 14 ) mm ,在SDS2PAGE方向偏差为( 1. 45 ±0. 21 ) mm。比较分析两种组织各7 例样本的2 2DE图谱,鼻息肉和鼻黏膜蛋白质点数为1 458 个和1 6 17 个, 平均匹配点数为1 0 26个。质谱分析差异蛋白质点40 个, 获取3 4 张PMF , 查询数据库鉴定出蛋白质24 个。结论: 建立了分辨率高和重复性好的鼻息肉及鼻黏膜2 2DE图谱,识别鉴定出一些与鼻息肉病变相关的蛋白质。



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TAG: 蛋白质组学鼻黏膜鼻息肉

 

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